16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0781 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 606 aa  1236    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3423  hypothetical protein  26.57 
 
 		 579 aa  193  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145169 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0052  hypothetical protein  23.73 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  28.8 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  27.34 
 
 		 583 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  24.48 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  25.93 
 
 		 210 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0143  hypothetical protein  23.95 
 
 		 571 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  22.92 
 
 		 608 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  28.39 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1427  hypothetical protein  24.11 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1510  KAP P-loop domain protein  22.59 
 
 		 643 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.706242  decreased coverage  3.38847e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4211  KAP P-loop  27.39 
 
 		 741 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.820288  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  24.09 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1493  hypothetical protein  23.72 
 
 		 624 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000440565  decreased coverage  0.000142627 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 469 aa  43.9  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>