45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0739 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  100 
 
 		 495 aa  1013    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  47.46 
 
 		 567 aa  336  5e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.03 
 
 		 533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  37.81 
 
 		 564 aa  279  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  26.22 
 
 		 611 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  24.35 
 
 		 679 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  22.45 
 
 		 659 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  24.12 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  24.48 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  31.05 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  26.9 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  28.72 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  24.19 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  23.87 
 
 		 358 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  24.35 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  24.35 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  23.23 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  24.35 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  24.35 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  24.35 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  24.32 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  23.99 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  23.27 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  26.94 
 
 		 661 aa  63.5  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  27.95 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  28.57 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  21.61 
 
 		 358 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  27.04 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  20.81 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  23.69 
 
 		 835 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  25 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3062  Spore coat protein CotH  26.61 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  25.88 
 
 		 610 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  23.14 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3397  Spore coat protein CotH  25.2 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3461  Spore coat protein CotH  25.2 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0390465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1128  hypothetical protein  27.4 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3379  spore coat protein CotH  25.9 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  24.14 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  26.38 
 
 		 673 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3317  spore coat assembly protein-like  24.8 
 
 		 557 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  25.29 
 
 		 621 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  22.1 
 
 		 702 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3876  hypothetical protein  24.82 
 
 		 947 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  24.14 
 
 		 819 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>