128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0738 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  75.62 
 
 
728 aa  1138    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  82.16 
 
 
728 aa  1239    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  88.55 
 
 
592 aa  1085    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  75.34 
 
 
734 aa  1110    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  77.27 
 
 
731 aa  1169    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  74.66 
 
 
734 aa  1108    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  93.08 
 
 
728 aa  1408    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  72.89 
 
 
735 aa  1093    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  74.14 
 
 
734 aa  1090    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  90.06 
 
 
742 aa  1368    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  89.68 
 
 
742 aa  1369    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  100 
 
 
728 aa  1503    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  72.53 
 
 
616 aa  886    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  89.64 
 
 
742 aa  1363    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  82.27 
 
 
727 aa  1229    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  77.06 
 
 
728 aa  1180    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  93.23 
 
 
729 aa  1409    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  89.76 
 
 
728 aa  1355    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  72.68 
 
 
734 aa  1108    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  91.2 
 
 
728 aa  1387    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  75.24 
 
 
732 aa  1140    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  75.48 
 
 
728 aa  1136    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  88.97 
 
 
728 aa  1350    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  93.37 
 
 
729 aa  1412    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  88.4 
 
 
728 aa  1326    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  89.47 
 
 
728 aa  1346    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  93.37 
 
 
729 aa  1411    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  75.62 
 
 
728 aa  1142    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  76.45 
 
 
728 aa  1160    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  90.17 
 
 
728 aa  1351    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  93.23 
 
 
729 aa  1408    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  76.45 
 
 
734 aa  1137    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  47.15 
 
 
587 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  47.15 
 
 
586 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  46.98 
 
 
586 aa  542  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  46.98 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  46.98 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  46.98 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  46.98 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  46.98 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  46.8 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  46.8 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  47.41 
 
 
587 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  46.39 
 
 
586 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  46.05 
 
 
611 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  45.7 
 
 
611 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  45.7 
 
 
597 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  45.88 
 
 
597 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  45.7 
 
 
586 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  47.06 
 
 
587 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  47.23 
 
 
587 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  46.05 
 
 
588 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  46.05 
 
 
588 aa  525  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  46.05 
 
 
588 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  46.29 
 
 
587 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  45.34 
 
 
582 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  44.7 
 
 
578 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  45.1 
 
 
576 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  41.03 
 
 
584 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  38.14 
 
 
592 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  39.46 
 
 
536 aa  352  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  33.79 
 
 
540 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  26.3 
 
 
618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  33.59 
 
 
134 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  34.38 
 
 
133 aa  96.3  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  32.81 
 
 
135 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  32.81 
 
 
135 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  35.94 
 
 
132 aa  93.6  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  34.68 
 
 
135 aa  90.1  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  32.28 
 
 
181 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  32.81 
 
 
135 aa  89  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  35.04 
 
 
134 aa  89  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  34.13 
 
 
135 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  35.24 
 
 
159 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  29.77 
 
 
135 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  30.77 
 
 
138 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  30.23 
 
 
127 aa  68.6  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  29.1 
 
 
134 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  26.55 
 
 
575 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  26.79 
 
 
138 aa  57.4  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  26.86 
 
 
580 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  26.06 
 
 
572 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  21.19 
 
 
745 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  21.92 
 
 
745 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  21.92 
 
 
745 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  25 
 
 
410 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  25 
 
 
410 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  29.36 
 
 
125 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  24.76 
 
 
248 aa  52  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  25.9 
 
 
402 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  21.11 
 
 
745 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  20.6 
 
 
745 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  24.6 
 
 
151 aa  51.2  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.27 
 
 
572 aa  51.2  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  21.74 
 
 
163 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  25.6 
 
 
140 aa  50.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  23.88 
 
 
486 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  27.5 
 
 
134 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>