More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0696 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  100 
 
 		 270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  61.36 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  60.52 
 
 		 265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  60.47 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  61.98 
 
 		 260 aa  315  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  54.61 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  53.38 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  53.38 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  53.38 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  52.16 
 
 		 280 aa  305  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  52.16 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  52.16 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  58.92 
 
 		 265 aa  299  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  58.82 
 
 		 283 aa  298  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.91 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  47.53 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  44.37 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  45.2 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  40.46 
 
 		 322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  42.11 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  40.08 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.69 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 311 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  38.95 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.8 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.42 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  34.77 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  44.02 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  58.45 
 
 		 297 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  43 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  34.48 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  53.99 
 
 		 415 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 417 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  48.47 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  50.27 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  50.57 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  56.34 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  48.07 
 
 		 332 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  50.29 
 
 		 341 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50.29 
 
 		 342 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  48.4 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  49.18 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 471 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  34.89 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 381 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  51.18 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  36.23 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  36.23 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  40.19 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 333 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  54.07 
 
 		 391 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  41.28 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  39.62 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  46.85 
 
 		 394 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  49.63 
 
 		 331 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  40.2 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  35.11 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  42.51 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  48.08 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  38.57 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  40.96 
 
 		 409 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  36.24 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  51.3 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  40.54 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  43.24 
 
 		 195 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  34.55 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  41.57 
 
 		 474 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  39.62 
 
 		 375 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  36.89 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  59.6 
 
 		 206 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  43.65 
 
 		 424 aa  131  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50 
 
 		 442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  58.59 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  38.36 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  38.14 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  38.14 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  38.14 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  45.35 
 
 		 421 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  55.75 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  59.8 
 
 		 212 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.7 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  45.35 
 
 		 419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  55.1 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  39.35 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.7 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.7 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.7 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.7 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.7 
 
 		 211 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>