More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0651 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  100 
 
 		 446 aa  890    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  43.25 
 
 		 439 aa  378  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  43.48 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  38.58 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  40.41 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  41.44 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  39 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  40.6 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  36.99 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  37.33 
 
 		 464 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  37.41 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  37.64 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  37.19 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  36.73 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 464 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  36.28 
 
 		 438 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 464 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  36.51 
 
 		 438 aa  302  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  35.6 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  36.04 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  35.65 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  35.36 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  35.14 
 
 		 453 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 453 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  35.1 
 
 		 476 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  34.95 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  34.95 
 
 		 456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  32.72 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  32.95 
 
 		 446 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  31.48 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.94 
 
 		 555 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  25 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  27.79 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  25.96 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  21.38 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  27.72 
 
 		 502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  26.48 
 
 		 480 aa  130  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.26 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.26 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.99 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.26 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.99 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.26 
 
 		 546 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.26 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 457 aa  126  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.13 
 
 		 484 aa  126  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  25.99 
 
 		 476 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  25.76 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.64 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  27.84 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.48 
 
 		 469 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.26 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.76 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.76 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.76 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.76 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.76 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  24.83 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 469 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.51 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  24.77 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>