More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0580 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  100 
 
 		 383 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  72.58 
 
 		 383 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  62.63 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  63.16 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  62.73 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  61.92 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  62.92 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  62.92 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  61.62 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  61.9 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  62.08 
 
 		 382 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  61.64 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.46 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  54.55 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  55.03 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  54.64 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  58.31 
 
 		 381 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  55.08 
 
 		 380 aa  352  7e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  52.56 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  53.32 
 
 		 379 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  54.71 
 
 		 387 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  44.9 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  43.93 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  44.47 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  43.43 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.93 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  43.82 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  43.44 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  42.93 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  42.54 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  43.77 
 
 		 425 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  41.73 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  40.62 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  42.51 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  42.51 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  44.97 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.89 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  42.51 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  43.51 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  42.13 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.8 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  41.97 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.8 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  42.78 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  42.97 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  43.29 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  42.12 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  40.43 
 
 		 401 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  39.35 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  41.51 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  42.25 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  41.62 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.12 
 
 		 391 aa  225  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  40.27 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  41.51 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  41.94 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  41.69 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  41.67 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  41.41 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  41.15 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  42.27 
 
 		 401 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  40.85 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  41.69 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  42.27 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  41.07 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  41.41 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  41.15 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  43.85 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  41.67 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  42.71 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  42.71 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  43.92 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  42.3 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.84 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.92 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  39.33 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.92 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  43.9 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.53 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  41.83 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  38.63 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  41.55 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.46 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  41.14 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  36.78 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  39.42 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  41.14 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  39.87 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.13 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  41.53 
 
 		 330 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  29.7 
 
 		 476 aa  139  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.89 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  41.67 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  53.9 
 
 		 158 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.18 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.24 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  27.15 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.34 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.92 
 
 		 389 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.72 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>