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for query gene Sfri_0500 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  80.23 
 
 
538 aa  844    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  81.09 
 
 
539 aa  858    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.63 
 
 
542 aa  868    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.73 
 
 
542 aa  867    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.63 
 
 
542 aa  869    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.89 
 
 
526 aa  863    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  83.73 
 
 
542 aa  866    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.46 
 
 
535 aa  863    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.27 
 
 
535 aa  860    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.27 
 
 
535 aa  858    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
543 aa  1107    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  73.24 
 
 
529 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  81.66 
 
 
526 aa  859    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  57.09 
 
 
534 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.97 
 
 
517 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.36 
 
 
516 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.17 
 
 
516 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.36 
 
 
516 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  51.57 
 
 
519 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.59 
 
 
516 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  52.15 
 
 
499 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.51 
 
 
539 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.09 
 
 
540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.57 
 
 
536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.51 
 
 
539 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.81 
 
 
519 aa  438  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.34 
 
 
535 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.83 
 
 
529 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.55 
 
 
523 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.66 
 
 
527 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 
527 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 
527 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 
527 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.76 
 
 
530 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 
514 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 
504 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 
527 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 
536 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.65 
 
 
516 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  38.8 
 
 
508 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 
524 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  39.16 
 
 
503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  37.13 
 
 
528 aa  333  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.31 
 
 
529 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.12 
 
 
529 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.7 
 
 
532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  37.74 
 
 
525 aa  326  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 
524 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 
523 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 
525 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 
530 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 
526 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.83 
 
 
511 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 
530 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.88 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 
523 aa  320  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 
529 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 
528 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.66 
 
 
532 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 
524 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 
525 aa  317  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  34.85 
 
 
529 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 
532 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 
524 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.18 
 
 
525 aa  316  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 
532 aa  316  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 
525 aa  316  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 
528 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 
524 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.17 
 
 
524 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.69 
 
 
531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 
528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 
524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.91 
 
 
523 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 
524 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 
524 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.22 
 
 
529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 
535 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 
543 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.69 
 
 
522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 
515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  36.86 
 
 
511 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 
528 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 
528 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 
528 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 
528 aa  301  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 
506 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 
515 aa  300  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 
517 aa  299  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
526 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 
515 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 
516 aa  296  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 
511 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 
528 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354181 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 
521 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
527 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 
528 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 
529 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal 
 
 
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