More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0432 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  64.02 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  60.5 
 
 		 201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  60.41 
 
 		 201 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  58.5 
 
 		 201 aa  242  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  56.5 
 
 		 201 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  57.3 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  56.78 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  58.29 
 
 		 201 aa  222  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  57.79 
 
 		 202 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  57.79 
 
 		 202 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  55.28 
 
 		 202 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  55.28 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  56.28 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  56.28 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  59.3 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.21 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  42.68 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  40.85 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  42.76 
 
 		 401 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 368 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  36.82 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  42.31 
 
 		 352 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 403 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  38.06 
 
 		 367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  40.91 
 
 		 394 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 		 365 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  42.57 
 
 		 381 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  37.23 
 
 		 392 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  35.15 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.82 
 
 		 370 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 367 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 367 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 373 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  40 
 
 		 380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  35.35 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  37.18 
 
 		 372 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 372 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 369 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.31 
 
 		 447 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 369 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 366 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  38.26 
 
 		 377 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 369 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  40.24 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 363 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.16 
 
 		 417 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.51 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.84 
 
 		 344 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.16 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  34.83 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.58 
 
 		 350 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.58 
 
 		 350 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 376 aa  101  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.16 
 
 		 429 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.49 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.49 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.49 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 368 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.81 
 
 		 345 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  36.24 
 
 		 373 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 		 468 aa  98.2  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 466 aa  97.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 457 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 314 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 366 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.49 
 
 		 351 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.67 
 
 		 427 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 454 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.24 
 
 		 337 aa  93.6  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.99 
 
 		 345 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.19 
 
 		 466 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.06 
 
 		 337 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 459 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  31.79 
 
 		 218 aa  91.7  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.59 
 
 		 319 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 428 aa  89.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.67 
 
 		 375 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 459 aa  88.2  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  45 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 		 376 aa  85.9  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  40.54 
 
 		 327 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 359 aa  84.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 335 aa  82  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.41 
 
 		 542 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 443 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.04 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  31.52 
 
 		 478 aa  79.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.67 
 
 		 543 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  32.87 
 
 		 388 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.75 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.52 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.78 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>