More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0391 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  61.91 
 
 		 737 aa  880    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  60.73 
 
 		 740 aa  891    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  61.67 
 
 		 748 aa  898    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  61.67 
 
 		 748 aa  898    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  61.62 
 
 		 711 aa  899    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  62.92 
 
 		 742 aa  904    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  62.92 
 
 		 742 aa  905    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 712 aa  1461    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  62.75 
 
 		 738 aa  919    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  61.24 
 
 		 749 aa  893    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  41.85 
 
 		 713 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 		 714 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.1 
 
 		 708 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 723 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 707 aa  251  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 724 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 694 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 715 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 724 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 792 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 850 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 720 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 720 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 721 aa  233  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 702 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 702 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 720 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 708 aa  231  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 714 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 715 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 720 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 738 aa  229  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 714 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 701 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 701 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 707 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 824 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 732 aa  226  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 770 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.92 
 
 		 703 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 815 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 701 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 727 aa  226  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 689 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 710 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 817 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 710 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 701 aa  224  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 708 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 719 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.34 
 
 		 713 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 701 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 710 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 711 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.84 
 
 		 709 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  28.94 
 
 		 715 aa  217  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 722 aa  217  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 706 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 701 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 736 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 708 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 706 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 719 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  28.12 
 
 		 699 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 710 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 860 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 736 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.85 
 
 		 689 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.27 
 
 		 695 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 701 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 859 aa  213  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.67 
 
 		 724 aa  213  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.01 
 
 		 706 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 843 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  27.59 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.2 
 
 		 711 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 734 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 828 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.72 
 
 		 713 aa  211  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  27.76 
 
 		 716 aa  210  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 809 aa  211  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 710 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.48 
 
 		 713 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 766 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 705 aa  208  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 812 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 724 aa  207  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 689 aa  207  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 714 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 821 aa  206  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 705 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 757 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 713 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 677 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 722 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 724 aa  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.25 
 
 		 708 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>