50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0322 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  53.45 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  54.22 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  54.22 
 
 		 168 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  54.22 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  54.22 
 
 		 168 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  48.85 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  52.32 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  52.91 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  53.89 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  53.29 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  52.67 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  45.83 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  38.92 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  45.81 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  44.25 
 
 		 183 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  32.02 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  32.26 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  34.46 
 
 		 208 aa  84.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  28.42 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  29.76 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  26.79 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  30.87 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  31.28 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  36.02 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  30.26 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  30.06 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  28.09 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  30.5 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  26.71 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  29.34 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  34.16 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  31.69 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  33.78 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  27.1 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  29.75 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  25.97 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  26.47 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  29.33 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  29.66 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  30.32 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  29.8 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  43.4 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  42.55 
 
 		 298 aa  41.2  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  34.67 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  43.75 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>