More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0246 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  63.2 
 
 
645 aa  854  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.15 
 
 
645 aa  815  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
644 aa  1328  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.66 
 
 
645 aa  857  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.2 
 
 
645 aa  850  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  62.08 
 
 
645 aa  811  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.53 
 
 
634 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.5 
 
 
645 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.75 
 
 
656 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.11 
 
 
656 aa  260  5e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.17 
 
 
665 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  34.92 
 
 
655 aa  258  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.55 
 
 
642 aa  255  1e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  34.26 
 
 
640 aa  253  8e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.75 
 
 
662 aa  253  9e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.75 
 
 
662 aa  253  9e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.11 
 
 
665 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.6 
 
 
662 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.16056e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.72 
 
 
662 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.08 
 
 
649 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
654 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  1.77281e-10 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40 
 
 
924 aa  243  8e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  28.7 
 
 
642 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.23 
 
 
632 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.32 
 
 
654 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.32 
 
 
657 aa  236  1e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  5.39912e-08 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.38 
 
 
646 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.05 
 
 
685 aa  233  8e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.52 
 
 
653 aa  232  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.61 
 
 
661 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.28 
 
 
644 aa  229  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.74 
 
 
907 aa  227  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.71 
 
 
662 aa  226  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  28.68 
 
 
649 aa  226  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.72 
 
 
655 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.83 
 
 
705 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.24 
 
 
654 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.95 
 
 
650 aa  223  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  27.64 
 
 
662 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  28.95 
 
 
665 aa  223  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.97 
 
 
706 aa  221  2e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  27.79 
 
 
636 aa  222  2e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.25 
 
 
632 aa  221  2e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 
755 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.84 
 
 
688 aa  220  8e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.46 
 
 
661 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.69 
 
 
682 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.61 
 
 
688 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  28.7 
 
 
653 aa  216  1e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.12 
 
 
662 aa  216  1e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.68 
 
 
652 aa  214  4e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 
623 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.23 
 
 
630 aa  212  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.8 
 
 
659 aa  210  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.69 
 
 
648 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.91 
 
 
686 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.44 
 
 
642 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  29 
 
 
653 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.38 
 
 
629 aa  202  2e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.12 
 
 
677 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.55 
 
 
686 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  37.95 
 
 
634 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.56 
 
 
626 aa  196  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.95 
 
 
665 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
626 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.34 
 
 
636 aa  193  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
641 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.1 
 
 
629 aa  191  3e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.53 
 
 
631 aa  191  3e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.8 
 
 
646 aa  187  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.42 
 
 
626 aa  184  5e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.42 
 
 
626 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.42 
 
 
626 aa  183  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  27.4 
 
 
681 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  36.03 
 
 
694 aa  177  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  32.08 
 
 
759 aa  176  2e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.15 
 
 
731 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.43 
 
 
650 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.84 
 
 
632 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  28.22 
 
 
596 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.41 
 
 
617 aa  148  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.33 
 
 
692 aa  147  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.32 
 
 
594 aa  143  1e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.95 
 
 
597 aa  140  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.76973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.73 
 
 
644 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.41 
 
 
719 aa  140  8e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.26 
 
 
666 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.89 
 
 
644 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.81 
 
 
638 aa  136  1e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.12 
 
 
596 aa  136  1e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.82 
 
 
600 aa  135  2e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.34 
 
 
628 aa  135  2e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  30.16 
 
 
661 aa  135  2e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 
612 aa  135  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
646 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.42 
 
 
633 aa  134  4e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.2 
 
 
571 aa  134  4e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.81 
 
 
652 aa  134  7e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.41 
 
 
677 aa  132  1e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.72 
 
 
629 aa  132  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>