More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0108 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  89.58 
 
 		 144 aa  266  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  88.89 
 
 		 144 aa  266  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  88.89 
 
 		 144 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  266  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  265  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  265  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  87.5 
 
 		 144 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  87.5 
 
 		 144 aa  263  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  88.19 
 
 		 144 aa  263  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  88.89 
 
 		 144 aa  261  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  81.69 
 
 		 143 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  74.1 
 
 		 144 aa  227  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  75.54 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  74.15 
 
 		 146 aa  223  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  74.82 
 
 		 146 aa  222  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  75.35 
 
 		 146 aa  221  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  74.81 
 
 		 150 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  71.81 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  74.83 
 
 		 147 aa  219  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 153 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  71.94 
 
 		 144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  69.78 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  69.06 
 
 		 151 aa  204  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  69.06 
 
 		 151 aa  204  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  69.06 
 
 		 151 aa  204  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  67.63 
 
 		 143 aa  203  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  69.06 
 
 		 151 aa  204  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  69.06 
 
 		 151 aa  204  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  70.37 
 
 		 148 aa  200  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  60.58 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03179  pseudopilin, cryptic, general secretion pathway  68.57 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0385  general secretion pathway protein G  68.57 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3522  general secretion pathway protein G  68.57 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.619829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03130  hypothetical protein  68.57 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  58.04 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0385  general secretion pathway protein G  67.86 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.106458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  62.96 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  62.96 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  62.96 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  58.74 
 
 		 144 aa  176  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  56.64 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  55.07 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  55.07 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  53.28 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 		 150 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 		 150 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  51.8 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  56.72 
 
 		 163 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  55.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  52.9 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  51.8 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  51.08 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  52.52 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  52.86 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  52.14 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  53.38 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  52.86 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  51.45 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  55.22 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  49.64 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  52.82 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  55.8 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  47.37 
 
 		 138 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  51.85 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  52.86 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  47.48 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  47.22 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  54.4 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  50.71 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  51.82 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  49.62 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  50.75 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  46.58 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  51.09 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  50.37 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  49.25 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>