46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0100 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  68.74 
 
 		 627 aa  877    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.83 
 
 		 683 aa  887    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  66.61 
 
 		 627 aa  836    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.49 
 
 		 683 aa  880    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.12 
 
 		 612 aa  885    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  68.82 
 
 		 615 aa  843    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.49 
 
 		 683 aa  883    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.76 
 
 		 663 aa  878    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  67.33 
 
 		 613 aa  858    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.83 
 
 		 684 aa  886    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  65.74 
 
 		 610 aa  812    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  70.02 
 
 		 659 aa  877    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 619 aa  1285    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  70.96 
 
 		 665 aa  877    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  70.96 
 
 		 658 aa  882    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.74 
 
 		 631 aa  589  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.21 
 
 		 609 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.58 
 
 		 634 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  38.37 
 
 		 634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  35.31 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.88 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.46 
 
 		 581 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.4 
 
 		 580 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  30.69 
 
 		 576 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  28.65 
 
 		 570 aa  254  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.55 
 
 		 577 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.88 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  27.66 
 
 		 575 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.16 
 
 		 526 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  24.21 
 
 		 484 aa  140  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.38 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.68 
 
 		 599 aa  99.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.77 
 
 		 618 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.86 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.36 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.36 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.6 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  23.92 
 
 		 840 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.22 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  22.75 
 
 		 823 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.21 
 
 		 361 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  19.88 
 
 		 906 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.81 
 
 		 422 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 497 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.63 
 
 		 557 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>