More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0082 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
337 aa  705    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.87 
 
 
337 aa  613  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.87 
 
 
337 aa  613  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.87 
 
 
337 aa  613  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.57 
 
 
337 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.87 
 
 
337 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  83.98 
 
 
337 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  83.38 
 
 
337 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  83.38 
 
 
337 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  86.5 
 
 
326 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  83.98 
 
 
337 aa  597  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  85.28 
 
 
326 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.05 
 
 
326 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  84.66 
 
 
326 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  81.38 
 
 
340 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0101  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.78 
 
 
337 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.012034  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.19 
 
 
329 aa  434  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.88 
 
 
329 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.58 
 
 
329 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.43 
 
 
326 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.43 
 
 
326 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.43 
 
 
326 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.96 
 
 
334 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.16 
 
 
327 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.53 
 
 
340 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.89 
 
 
340 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.41 
 
 
329 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.41 
 
 
329 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.41 
 
 
329 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  58.41 
 
 
329 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.41 
 
 
329 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.41 
 
 
329 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.41 
 
 
329 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.1 
 
 
329 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.8 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0865  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.8 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0896  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.8 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.76 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.8 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0928  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.49 
 
 
329 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.92 
 
 
338 aa  403  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.23 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.76 
 
 
340 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.76 
 
 
340 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.35 
 
 
340 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.66 
 
 
322 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.7 
 
 
323 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50 
 
 
326 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.47 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02199  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.04 
 
 
294 aa  333  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.18 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0217  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.43 
 
 
437 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0611  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.17 
 
 
369 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.28 
 
 
367 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.48 
 
 
280 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.53 
 
 
327 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.31 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.37 
 
 
329 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37 
 
 
327 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37 
 
 
327 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.7 
 
 
327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.7 
 
 
327 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  37.5 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37 
 
 
327 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.54 
 
 
328 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.39 
 
 
344 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.28 
 
 
332 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  37.72 
 
 
339 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.39 
 
 
327 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.35 
 
 
356 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.3 
 
 
331 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.11 
 
 
331 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.15 
 
 
328 aa  225  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.27 
 
 
330 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.3 
 
 
343 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.75 
 
 
349 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.61 
 
 
334 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.39 
 
 
353 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.04 
 
 
356 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.69 
 
 
334 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.89 
 
 
341 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.55 
 
 
345 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.84 
 
 
328 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 
329 aa  222  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.96 
 
 
346 aa  221  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.53 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  36.09 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.89 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.7 
 
 
326 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  35.47 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.7 
 
 
326 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.54 
 
 
328 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.13 
 
 
344 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  35.67 
 
 
343 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.76 
 
 
344 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.05 
 
 
331 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.78 
 
 
345 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.46 
 
 
348 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>