More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0077 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  70.71 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  71.43 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  71.07 
 
 		 279 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  71.79 
 
 		 283 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  70.71 
 
 		 279 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  70.36 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  70.36 
 
 		 284 aa  377  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  70 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  72.14 
 
 		 282 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  70 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.36 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  66.19 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  67.5 
 
 		 286 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  66.43 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  65.12 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  23.13 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  30.48 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  29.29 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  25.26 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  26.59 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  23.27 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  23.08 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  25.49 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  27.43 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  24.27 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  36.73 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  36.73 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  36.73 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  36.73 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  36.73 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  25.1 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  23.24 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  21.93 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  25.53 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.61 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  24.03 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  23.97 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  24.41 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  23.97 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  23.64 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  24.41 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  23.97 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  27 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  22.51 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  25.1 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  23.51 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  27 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  23.97 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  27 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  23.97 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  27 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  24.73 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  24.28 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  25.1 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  25.1 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.91 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 		 398 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  27.54 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  38.16 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  20.07 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  20.07 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  27.2 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  27.2 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  27.2 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  27.2 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  35.64 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.54 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  27.2 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  23.34 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  22.46 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  24.28 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  28.77 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  24.24 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  22.52 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  23.34 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  23.29 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  23.29 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  23.08 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  23.29 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  27.2 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  23.34 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  23.29 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  23.9 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  23.29 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  23.29 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  23.29 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  23.97 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  23.29 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  23.29 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  23.55 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  23.28 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  24.41 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.51 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  26.09 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>