12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0066 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  255  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  60.8 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  39.06 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  39.5 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  39.5 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  43 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  34.91 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  28.57 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  34.95 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2265  membrane protein-like protein  34.41 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953677  normal  0.0891239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  34 
 
 		 214 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  31.48 
 
 		 400 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>