23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0053 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  45.16 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  52.91 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  56.46 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  46.63 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  48.97 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  49.32 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  48.65 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  48.65 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  41.45 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  49.32 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  41.97 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  45.45 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4141  hypothetical protein  48.03 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  32.52 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  26.43 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  41.82 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  28.77 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  28.77 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  31.03 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  31.97 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>