26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0052 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  326  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  78.52 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  76.82 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  76.51 
 
 		 156 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  73.68 
 
 		 155 aa  249  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  71.14 
 
 		 154 aa  240  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  70.07 
 
 		 154 aa  236  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  69.39 
 
 		 154 aa  234  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  69.39 
 
 		 154 aa  234  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  69.39 
 
 		 154 aa  234  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  69.39 
 
 		 154 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  69.39 
 
 		 154 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  69.39 
 
 		 154 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  69.39 
 
 		 154 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  74.65 
 
 		 152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  37.06 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  35.56 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  33.78 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  33.82 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  28.48 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  27.15 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  24.68 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  30.86 
 
 		 180 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  24.67 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  28.1 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>