More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0047 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  55.65 
 
 		 867 aa  875    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  56.56 
 
 		 965 aa  1039    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  56.88 
 
 		 935 aa  1007    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  56.17 
 
 		 936 aa  1006    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  58.33 
 
 		 951 aa  1053    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  57.09 
 
 		 856 aa  921    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  53.33 
 
 		 938 aa  918    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  56.35 
 
 		 865 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  57.16 
 
 		 938 aa  1027    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  55.62 
 
 		 871 aa  850    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  55.96 
 
 		 936 aa  1004    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  55.71 
 
 		 871 aa  848    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 		 945 aa  1921    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  55.58 
 
 		 869 aa  907    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  59.14 
 
 		 951 aa  1074    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  57.21 
 
 		 865 aa  970    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  37.05 
 
 		 918 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  35.3 
 
 		 751 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  34.05 
 
 		 794 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  33.74 
 
 		 794 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  33.84 
 
 		 812 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  33.88 
 
 		 795 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  33.88 
 
 		 795 aa  373  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.13 
 
 		 796 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  33.33 
 
 		 796 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.92 
 
 		 795 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.92 
 
 		 795 aa  370  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  33.33 
 
 		 795 aa  370  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.88 
 
 		 796 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.8 
 
 		 795 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.92 
 
 		 795 aa  370  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.33 
 
 		 795 aa  370  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  32.63 
 
 		 795 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  33.16 
 
 		 795 aa  364  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.6 
 
 		 796 aa  363  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  32.25 
 
 		 799 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  31.62 
 
 		 799 aa  361  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  32.38 
 
 		 799 aa  360  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  32.38 
 
 		 799 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  32.38 
 
 		 799 aa  354  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  32.38 
 
 		 799 aa  354  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  32.38 
 
 		 799 aa  354  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  32.25 
 
 		 799 aa  352  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  32.25 
 
 		 799 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  33.75 
 
 		 795 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  31.32 
 
 		 770 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  31.31 
 
 		 763 aa  230  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  31.25 
 
 		 764 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  31.16 
 
 		 763 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.06 
 
 		 927 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.05 
 
 		 744 aa  211  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.51 
 
 		 1045 aa  205  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  29.72 
 
 		 746 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  28.63 
 
 		 781 aa  204  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  29.26 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  28.15 
 
 		 806 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  28.5 
 
 		 760 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  26.92 
 
 		 924 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  26.25 
 
 		 768 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  27.53 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.28 
 
 		 747 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  24.66 
 
 		 825 aa  125  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  39.51 
 
 		 918 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  31.74 
 
 		 1862 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  37.57 
 
 		 675 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  40.3 
 
 		 1236 aa  92.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  37.21 
 
 		 581 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.58 
 
 		 669 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  30.53 
 
 		 1120 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.57 
 
 		 816 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  37.44 
 
 		 910 aa  86.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  38.18 
 
 		 685 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.19 
 
 		 859 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.82 
 
 		 2272 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  35.06 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.86 
 
 		 679 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  33.5 
 
 		 1150 aa  84.3  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  34.81 
 
 		 713 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  39.29 
 
 		 658 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  34.87 
 
 		 1300 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  34.65 
 
 		 1241 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.37 
 
 		 3295 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  35.23 
 
 		 2036 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1682 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  31.73 
 
 		 1057 aa  82  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 623 aa  82.4  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  34.76 
 
 		 1565 aa  82  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.65 
 
 		 752 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 1732 aa  82  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  37.57 
 
 		 1667 aa  82  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  36.94 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  24.07 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  29.88 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  36.63 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  36.16 
 
 		 1969 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  34.81 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  39.19 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  36.54 
 
 		 644 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  31.03 
 
 		 1095 aa  79.7  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  36.09 
 
 		 528 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>