18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0044 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  69.75 
 
 		 553 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  66.43 
 
 		 552 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  66.25 
 
 		 552 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1065    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  67.03 
 
 		 552 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  67.15 
 
 		 551 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  66.31 
 
 		 561 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  66.55 
 
 		 559 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  71.4 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  70.45 
 
 		 515 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  67.32 
 
 		 509 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  68.52 
 
 		 540 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  63.94 
 
 		 537 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  62.71 
 
 		 550 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  61.58 
 
 		 504 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  60.99 
 
 		 535 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  45.45 
 
 		 714 aa  180  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.22 
 
 		 620 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>