193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0040 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  56.32 
 
 
595 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  73.45 
 
 
601 aa  922    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  65.89 
 
 
599 aa  828    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  57.61 
 
 
589 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  73.61 
 
 
601 aa  928    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  73.61 
 
 
601 aa  929    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  72.64 
 
 
591 aa  917    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  74.75 
 
 
603 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  73.78 
 
 
601 aa  931    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  74.92 
 
 
603 aa  951    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  72.36 
 
 
619 aa  866    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  57.42 
 
 
583 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  74.75 
 
 
603 aa  948    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  74.39 
 
 
594 aa  900    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  74.25 
 
 
603 aa  943    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  75.25 
 
 
603 aa  951    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  73.99 
 
 
599 aa  913    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  72.73 
 
 
599 aa  900    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  51.17 
 
 
588 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  48.92 
 
 
587 aa  555  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  45.83 
 
 
590 aa  519  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  44.33 
 
 
598 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  43.69 
 
 
613 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  46.87 
 
 
621 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  43.87 
 
 
593 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  41.87 
 
 
1283 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  44.87 
 
 
586 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  43.33 
 
 
584 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  39.92 
 
 
619 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.2 
 
 
611 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.18 
 
 
585 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  37.27 
 
 
621 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.36 
 
 
609 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  33.98 
 
 
611 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.17 
 
 
611 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  34.2 
 
 
609 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  32.96 
 
 
609 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  32.96 
 
 
609 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  32.8 
 
 
609 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  33.95 
 
 
609 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  33.28 
 
 
610 aa  365  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  32.53 
 
 
609 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.93 
 
 
607 aa  364  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  32.32 
 
 
609 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  33.11 
 
 
609 aa  360  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  34.51 
 
 
629 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  34.09 
 
 
617 aa  350  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  33.57 
 
 
616 aa  349  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  34.03 
 
 
616 aa  349  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  33.98 
 
 
637 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  32.26 
 
 
635 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  35.87 
 
 
592 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.84 
 
 
609 aa  343  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  33.83 
 
 
614 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  35.34 
 
 
628 aa  337  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  33.01 
 
 
602 aa  336  7e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  34.3 
 
 
610 aa  336  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  33.88 
 
 
615 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  35.76 
 
 
608 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  33.99 
 
 
615 aa  330  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  33.93 
 
 
615 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.41 
 
 
625 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  34.66 
 
 
605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.11 
 
 
618 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  34.64 
 
 
610 aa  326  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  35.39 
 
 
608 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34.04 
 
 
616 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  34.12 
 
 
625 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  33.88 
 
 
616 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  32.57 
 
 
613 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  33.88 
 
 
616 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  32.15 
 
 
628 aa  321  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  34.45 
 
 
615 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  33.72 
 
 
616 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  34.18 
 
 
566 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  33.69 
 
 
617 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.81 
 
 
605 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  32.47 
 
 
593 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  32.42 
 
 
627 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  33.07 
 
 
629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  34.14 
 
 
589 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  32.75 
 
 
613 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  34.18 
 
 
593 aa  307  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  35.17 
 
 
607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  35.17 
 
 
607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  34.87 
 
 
614 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  35.17 
 
 
607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  33.39 
 
 
624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.49 
 
 
614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  34.99 
 
 
614 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  34.93 
 
 
617 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.82 
 
 
614 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  30.69 
 
 
646 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  33.05 
 
 
611 aa  297  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  33.16 
 
 
621 aa  296  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.84 
 
 
551 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  33.11 
 
 
618 aa  293  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  31.78 
 
 
608 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  33.39 
 
 
622 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>