116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0033 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  100 
 
 		 418 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  57.49 
 
 		 430 aa  478  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  54.28 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  35.93 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  34.63 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  36.64 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  35.68 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  33.17 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  32.02 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  33.01 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  31.22 
 
 		 429 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  31.71 
 
 		 429 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  30.93 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  30.25 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  31.46 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  27.41 
 
 		 429 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  30.97 
 
 		 448 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  29.79 
 
 		 448 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.26 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  28.92 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  27.23 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  29.41 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.21 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  28.54 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  28.17 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  28.03 
 
 		 385 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  27.1 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  30.55 
 
 		 419 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  27.32 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  27.85 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  28.1 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  27.13 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  27.59 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.95 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  28.81 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  29.72 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  28.99 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  28.57 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  26.58 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  29.67 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  26.58 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.42 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  28.39 
 
 		 1498 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  26.53 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  30.43 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  27.35 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.65 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  27.37 
 
 		 389 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  28.01 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  26.7 
 
 		 383 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  27.49 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  27.54 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  27.91 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  25.17 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  27.49 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  24.67 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  26.79 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  27.95 
 
 		 376 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  26.94 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  25.33 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  26.1 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  26.79 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  26.79 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  26.79 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  26.53 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  25.07 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  26.61 
 
 		 373 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  26.53 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  26.79 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  26.26 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  26.26 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  25.19 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  26.88 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  26.67 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  26.63 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  27.42 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  26.71 
 
 		 1020 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  24.36 
 
 		 1010 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  26.76 
 
 		 988 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  24.11 
 
 		 1024 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  26.65 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  25.17 
 
 		 1024 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  22.37 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  25.06 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  24.53 
 
 		 1029 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  26.25 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  22.86 
 
 		 582 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1029 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  25 
 
 		 1021 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  23.33 
 
 		 1046 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  24.82 
 
 		 1029 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  24.82 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  24.77 
 
 		 839 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  23.83 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  24.07 
 
 		 1024 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  24.36 
 
 		 908 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  26.12 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  25.44 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  23.72 
 
 		 1018 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>