145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0031 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0031  globin  100 
 
 		 144 aa  303  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  80.42 
 
 		 156 aa  253  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  75.69 
 
 		 145 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  74.31 
 
 		 145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  74.31 
 
 		 145 aa  231  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  72.92 
 
 		 145 aa  226  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  71.33 
 
 		 144 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  71.23 
 
 		 145 aa  219  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  71.23 
 
 		 145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  71.23 
 
 		 145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  69.23 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  70.83 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  69.23 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  64.34 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  64.19 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  43.44 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  42.86 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  40.43 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  41.48 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  41.8 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  42.62 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  39.2 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  44.72 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  42.74 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  43.09 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  40.98 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  43.09 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  40.98 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  39.23 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  40.46 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  38.69 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  38.46 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  38.46 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  42.28 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  40.46 
 
 		 136 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  40.46 
 
 		 136 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  42.86 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  42.86 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  39.23 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  39.2 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  39.69 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  38.46 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  39.69 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  39.5 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  38.33 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  40.34 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  42.86 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  41.8 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  40.77 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  41.13 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  38.52 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  41.13 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  37.6 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  38.66 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  39.17 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  39.5 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  37.4 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  39.66 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  38.52 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  38.52 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  36.43 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  32.81 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  36.13 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  37.6 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  36.29 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  36.22 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3575  globin  37.96 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  35.4 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  31.85 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  31.93 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  31.93 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  34.43 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  31.93 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  31.93 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  31.93 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  31.93 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  31.93 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  31.93 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  31.93 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  31.4 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  30.89 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  34.51 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  35.54 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  35.87 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  33.33 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  30.33 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  29.6 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  39.22 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  29.2 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  33.06 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  34.11 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1541  hypothetical protein  33.05 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  30.89 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  33.06 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>