185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0041 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  87.8 
 
 		 560 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  90.19 
 
 		 509 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  89.47 
 
 		 572 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  89.47 
 
 		 562 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  100 
 
 		 422 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  63.61 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 551 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  42.57 
 
 		 556 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  42.57 
 
 		 556 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  42.57 
 
 		 556 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  42.57 
 
 		 556 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  38.65 
 
 		 625 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  37.38 
 
 		 626 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  37.07 
 
 		 640 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  39.13 
 
 		 630 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  36.34 
 
 		 640 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  36.34 
 
 		 640 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  35.15 
 
 		 616 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  35.77 
 
 		 611 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  40.29 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  40.4 
 
 		 547 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  38.97 
 
 		 541 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  38.97 
 
 		 541 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  38.97 
 
 		 541 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  38.97 
 
 		 541 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  34.88 
 
 		 595 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  36.67 
 
 		 640 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  36.67 
 
 		 632 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  32.39 
 
 		 618 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  32.39 
 
 		 618 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  35.45 
 
 		 614 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  34.43 
 
 		 636 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  40.37 
 
 		 547 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  37.25 
 
 		 542 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  31.37 
 
 		 618 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  35.77 
 
 		 552 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  46.25 
 
 		 497 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  34.93 
 
 		 550 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2334  integrase, catalytic region  83.33 
 
 		 140 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.812874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 		 560 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  36.04 
 
 		 617 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  35.34 
 
 		 617 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  35.63 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  34.89 
 
 		 677 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  34.89 
 
 		 652 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  34.89 
 
 		 652 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  34.89 
 
 		 652 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  29.95 
 
 		 649 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  30.99 
 
 		 704 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0321  TniAdelta1  51.3 
 
 		 168 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.108284  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  27.02 
 
 		 733 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  31.16 
 
 		 670 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  30.36 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  41.84 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  28.47 
 
 		 558 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  30.72 
 
 		 710 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  28.24 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  27.47 
 
 		 902 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 		 782 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  25.9 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 		 560 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  31.9 
 
 		 785 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.06 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  25.61 
 
 		 902 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.27 
 
 		 636 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  26.69 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.69 
 
 		 721 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21.87 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21.87 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  31.38 
 
 		 810 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  25.75 
 
 		 900 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  25.75 
 
 		 900 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 497 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 497 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 497 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 		 663 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  26.24 
 
 		 782 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  29.62 
 
 		 754 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  24.18 
 
 		 917 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  30.09 
 
 		 581 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  28.21 
 
 		 650 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  24.41 
 
 		 696 aa  90.5  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  29.03 
 
 		 300 aa  89.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 905 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 905 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 905 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 905 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 905 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.05 
 
 		 567 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 662 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 662 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  28.9 
 
 		 575 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 614 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 614 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 614 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  24.35 
 
 		 644 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>