279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4580 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4580  chaperone protein ClpE  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3925  putative fimbrial assembly chaperone FanE  38.32 
 
 		 226 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  37.5 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  36.43 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  29.39 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.06 
 
 		 232 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.06 
 
 		 232 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  37.06 
 
 		 232 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  30.13 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  37.06 
 
 		 232 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  29.55 
 
 		 227 aa  99  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  31.98 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  31.98 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  28.4 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  30.99 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  33.78 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  31.98 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  31.98 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  29 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  30.73 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  33.04 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.98 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  32.62 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  29.17 
 
 		 248 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  30.28 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  30.28 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  30.52 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  30.66 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  28 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  28.06 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.17 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.03 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  28.44 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.44 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  28.44 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  31.34 
 
 		 216 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  30.69 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.78 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  28.44 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  30.13 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  28.44 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  30.14 
 
 		 231 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  28.26 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  28.03 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  31.03 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  33.94 
 
 		 226 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  34.21 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  31.63 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  31.03 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  31.03 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  28.7 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  31.63 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  27.83 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  27.98 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  34.13 
 
 		 229 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.33 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.33 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.69 
 
 		 243 aa  89  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  30.57 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  30.04 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  30.04 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  30.04 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  30.04 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  34.3 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  31.55 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  31.55 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.05 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  31.55 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  34.3 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  29.66 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  34.44 
 
 		 227 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  34.44 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  30.82 
 
 		 225 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.39 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  33.33 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  30.77 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.31 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  30.53 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  31.88 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  29.95 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.44 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  27.69 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  29.2 
 
 		 238 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  30.53 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  27.69 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.89 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  33.89 
 
 		 227 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.52 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  30.53 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.43 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.89 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  30.53 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  32.79 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  27.96 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  27.69 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.55 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  30.77 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  27.69 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>