100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4530 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  100 
 
 		 188 aa  393  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  99.47 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  99.47 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  99.47 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  99.47 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  88.3 
 
 		 188 aa  352  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.3 
 
 		 188 aa  352  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.3 
 
 		 188 aa  352  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.3 
 
 		 188 aa  352  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  88.3 
 
 		 188 aa  352  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  88.3 
 
 		 188 aa  352  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  87.77 
 
 		 188 aa  350  8e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  87.77 
 
 		 188 aa  350  8e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  87.77 
 
 		 188 aa  350  8e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  74.21 
 
 		 189 aa  288  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  73.68 
 
 		 189 aa  288  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  29.79 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1998  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.94 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02726  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.95 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  33.73 
 
 		 154 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  31.58 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  33.76 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  34.16 
 
 		 166 aa  84.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  30.91 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  35.48 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  30.06 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  31.64 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4285  formate-dependent nitrite reductase  32.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0181  formate-dependent nitrite reductase  32.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  30.72 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4153  formate-dependent nitrite reductase  32.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  32.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  30.72 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  30.32 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  30.12 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  34.35 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  31.38 
 
 		 326 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  32.78 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  31.28 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  31.37 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  30.48 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  29.03 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  29.41 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  28.49 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  29.41 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  29.28 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  30.71 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  26.55 
 
 		 309 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  31.34 
 
 		 333 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  31.34 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  28.77 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  31.34 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  28.8 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  31.34 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  28.27 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  32.14 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  32.86 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  29.85 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  31.61 
 
 		 286 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  27.89 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  29.59 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  31.72 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  32.84 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  28.8 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  32.84 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  32.84 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  29.41 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  28.12 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  26.87 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.92 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  26.77 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  27.13 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  25.93 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  25.84 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  27.38 
 
 		 304 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  27.52 
 
 		 618 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  23.68 
 
 		 616 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  26.98 
 
 		 316 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  28.68 
 
 		 317 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  26.12 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  26.38 
 
 		 317 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  28.12 
 
 		 287 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  25 
 
 		 540 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  27.59 
 
 		 259 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  25.14 
 
 		 363 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  27.61 
 
 		 670 aa  45.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  25.66 
 
 		 619 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 315 aa  44.7  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  23.72 
 
 		 577 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.17 
 
 		 757 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  21.82 
 
 		 616 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  25.26 
 
 		 362 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  27.87 
 
 		 758 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  29.9 
 
 		 307 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.69 
 
 		 656 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  26.11 
 
 		 618 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.14 
 
 		 589 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>