26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4451 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4451  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000182249  unclonable  0.00000000157695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2153  hypothetical protein  97.57 
 
 
329 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000696662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2477  hypothetical protein  85.11 
 
 
331 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0132225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2279  hypothetical protein  85.71 
 
 
331 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00859838  hitchhiker  4.1808499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2614  hypothetical protein  63.83 
 
 
329 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4112  decreased coverage  0.00553167 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2083  protein of unknown function DUF1277  56.73 
 
 
349 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000880511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2076  hypothetical protein  56.73 
 
 
349 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1767  hypothetical protein  56.73 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000332816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  53.87 
 
 
349 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000639622  hitchhiker  0.000000000128788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  53.87 
 
 
349 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  54.15 
 
 
349 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1434  hypothetical protein  53.3 
 
 
349 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000482166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  53.01 
 
 
349 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  0.000000000247351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  53.74 
 
 
348 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000197181  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  52.72 
 
 
349 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000141733  hitchhiker  0.0000000024539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  52.72 
 
 
349 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  52.72 
 
 
349 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000300414  hitchhiker  0.0000000000395416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2253  hypothetical protein  53.08 
 
 
339 aa  355  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215699  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1440  hypothetical protein  47.84 
 
 
351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1174  hypothetical protein  47.84 
 
 
351 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000255184  hitchhiker  0.000000000000402769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1266  hypothetical protein  47.26 
 
 
351 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00314635  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01529  predicted protein  68.48 
 
 
192 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.271996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01963  hypothetical protein  32.83 
 
 
323 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1003  hypothetical protein  48.32 
 
 
168 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.787679  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0881  hypothetical protein  40.68 
 
 
224 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0865  hypothetical protein  40.68 
 
 
224 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>