26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4449 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4449  bacteriophage V crossover junction endodeoxyribonuclease  100 
 
 
129 aa  267  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00181578  unclonable  1.15544e-09 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2155  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  98.45 
 
 
129 aa  263  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.59574e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  79.84 
 
 
129 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1175  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  40.98 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.77122e-06  hitchhiker  2.01219e-13 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2799  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  40.98 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.629369  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  40.16 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00142112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1764  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.98 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.87819e-08  hitchhiker  0.00606421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1435  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  40.16 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1845  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.68 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.55271e-06  hitchhiker  1.07565e-09 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3154  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.68 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.95998e-06  hitchhiker  1.79448e-11 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1159  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.48 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.52129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1260  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.68 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000987444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0300  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  38.84 
 
 
120 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  40.68 
 
 
120 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  41.03 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  38.52 
 
 
119 aa  83.2  1e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565025  hitchhiker  1.404e-10 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1441  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  39.06 
 
 
126 aa  82.4  2e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  38.98 
 
 
120 aa  81.3  5e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  39.83 
 
 
120 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  38.14 
 
 
120 aa  74.7  3e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3595  endodeoxyribonuclease RusA  36.75 
 
 
120 aa  58.2  3e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1523  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.74 
 
 
85 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1129  endodeoxyribonuclease RusA  35.92 
 
 
119 aa  55.1  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00235578  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0872  endodeoxyribonuclease RusA  31.37 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2324  endodeoxyribonuclease RusA  27.27 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2442  hypothetical protein  28.07 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>