55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4446 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  100 
 
 
313 aa  649  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  1.41211e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  59.33 
 
 
315 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.80847e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  56.36 
 
 
320 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  55.08 
 
 
295 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  1.06842e-13 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  46.24 
 
 
321 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  45.11 
 
 
339 aa  222  5e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  45.22 
 
 
304 aa  222  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  45.11 
 
 
321 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  98.73 
 
 
455 aa  164  2e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  29.17 
 
 
355 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  6.03764e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  28.1 
 
 
338 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  32.02 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  3.57424e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  26.76 
 
 
334 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  27.59 
 
 
274 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  30.09 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  30.09 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  34.9 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  37.74 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  23.94 
 
 
301 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  29.59 
 
 
274 aa  79.7  6e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  38.2 
 
 
282 aa  65.9  8e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  42.42 
 
 
249 aa  58.9  1e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  42.42 
 
 
244 aa  58.9  1e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  42.42 
 
 
249 aa  58.9  1e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  42.42 
 
 
249 aa  58.9  1e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  4.25732e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  31.4 
 
 
251 aa  57.4  3e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 
249 aa  56.2  7e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  1.19584e-08  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  27.2 
 
 
278 aa  55.5  1e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  43.48 
 
 
326 aa  54.7  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.18934e-24 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  28.93 
 
 
263 aa  54.3  3e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  28 
 
 
278 aa  54.3  3e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  28 
 
 
278 aa  54.3  3e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  28.24 
 
 
278 aa  53.5  4e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  28.24 
 
 
278 aa  53.5  5e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  7.47295e-06 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  43.33 
 
 
411 aa  53.1  6e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2872  hypothetical protein  31.82 
 
 
314 aa  51.2  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  40.32 
 
 
243 aa  50.4  3e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  4.36094e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  26.4 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  4.70201e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5070  hypothetical protein  25.64 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4662  hypothetical protein  26.28 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4643  hypothetical protein  26.28 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0173  hypothetical protein  27.78 
 
 
293 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  26.67 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  7.38533e-07  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  41.38 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5164  hypothetical protein  25.64 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4801  hypothetical protein  25.64 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5041  hypothetical protein  27.08 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2069  hypothetical protein  23.98 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5068  hypothetical protein  30.86 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3007  hypothetical protein  28.44 
 
 
247 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  38.03 
 
 
285 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  38.03 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  38.03 
 
 
285 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>