121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3648 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.94242e-05  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.48293e-05  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.57298e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.08468e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  98.33 
 
 
240 aa  490  1e-138  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.42414e-07  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.29937e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.88396e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  3.85535e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.15981e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.61494e-06  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  97.92 
 
 
240 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  96.25 
 
 
240 aa  477  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  87.92 
 
 
249 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  87.5 
 
 
240 aa  440  1e-122  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  86.25 
 
 
248 aa  437  1e-122  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  85.83 
 
 
240 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.95528e-08  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  85.83 
 
 
248 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  86.67 
 
 
240 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  86.67 
 
 
240 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  86.67 
 
 
240 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  68.75 
 
 
238 aa  321  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  70.83 
 
 
226 aa  319  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.31987e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  67.41 
 
 
240 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.30271e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  66.52 
 
 
237 aa  309  3e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  67.89 
 
 
222 aa  286  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  47.44 
 
 
218 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  42.99 
 
 
226 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  40.38 
 
 
225 aa  184  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  42.52 
 
 
226 aa  184  1e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  39.91 
 
 
222 aa  181  9e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  44.04 
 
 
215 aa  177  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  39.55 
 
 
221 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  40.27 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  40.27 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  41.36 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  39.82 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  41.4 
 
 
219 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  41.4 
 
 
219 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  41.4 
 
 
219 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  41.4 
 
 
219 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  39.63 
 
 
223 aa  168  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  38.46 
 
 
227 aa  168  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  42.11 
 
 
221 aa  163  2e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  43.63 
 
 
211 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  38.46 
 
 
218 aa  152  3e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  38.25 
 
 
219 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  34.91 
 
 
222 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  34.1 
 
 
225 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  29.44 
 
 
223 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  31.37 
 
 
221 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  32.57 
 
 
223 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  31.22 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  30.48 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  29.86 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  30.48 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  29.17 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  29.33 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  28.16 
 
 
580 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  25.98 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.17954e-05  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  29.5 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  33.66 
 
 
224 aa  84.3  1e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  30.09 
 
 
224 aa  85.1  1e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0272  hypothetical protein  30.14 
 
 
212 aa  82.8  4e-15  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  28.44 
 
 
212 aa  82  7e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  29.9 
 
 
218 aa  80.5  2e-14  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  33.86 
 
 
206 aa  79.3  4e-14  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  29.38 
 
 
224 aa  79  7e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  28.24 
 
 
211 aa  78.6  8e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  28.92 
 
 
218 aa  78.6  8e-14  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  1.07006e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  27.85 
 
 
215 aa  78.2  1e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  28.92 
 
 
218 aa  77.4  2e-13  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  26.24 
 
 
213 aa  73.6  3e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  26.24 
 
 
213 aa  73.6  3e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  25.55 
 
 
224 aa  72.8  4e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  26.79 
 
 
210 aa  73.2  4e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  27.92 
 
 
263 aa  72.4  6e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  26.03 
 
 
216 aa  71.2  1e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  5.40056e-13 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  25.6 
 
 
210 aa  71.6  1e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  28.71 
 
 
213 aa  70.9  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  24.54 
 
 
207 aa  70.5  2e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  25.59 
 
 
210 aa  70.5  3e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  24.17 
 
 
214 aa  69.7  4e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  26.27 
 
 
224 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  26.67 
 
 
222 aa  67  3e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  27.32 
 
 
224 aa  66.6  3e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  25.73 
 
 
201 aa  66.6  3e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  26.36 
 
 
234 aa  66.6  3e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  27.18 
 
 
209 aa  66.2  4e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  23.72 
 
 
206 aa  66.2  4e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  26.01 
 
 
274 aa  65.9  5e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  23.9 
 
 
217 aa  65.5  8e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  24 
 
 
212 aa  65.1  9e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  24.87 
 
 
212 aa  64.3  1e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  24.14 
 
 
208 aa  63.9  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  23.88 
 
 
236 aa  63.5  3e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  22.75 
 
 
212 aa  62.8  5e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  22.75 
 
 
212 aa  62.8  5e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>