84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3647 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3647  sulfur transfer complex subunit TusD  100 
 
 
128 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.27633e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3648  sulfur transfer complex subunit TusD  100 
 
 
128 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.44456e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3756  sulfur transfer complex subunit TusD  100 
 
 
128 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0264721  normal  0.126397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3819  sulfur transfer complex subunit TusD  99.22 
 
 
128 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  7.09397e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3721  sulfur transfer complex subunit TusD  98.44 
 
 
128 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  6.3016e-06  normal  0.0742653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03147  hypothetical protein  87.5 
 
 
128 aa  235  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.55048e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3814  sulfur transfer complex subunit TusD  87.5 
 
 
128 aa  235  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.89163e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3541  sulfur transfer complex subunit TusD  87.5 
 
 
128 aa  235  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.84382e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03196  hypothetical protein  87.5 
 
 
128 aa  235  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.10262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3719  sulfur transfer complex subunit TusD  86.72 
 
 
128 aa  232  1e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.89311e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0368  sulfur transfer complex subunit TusD  85.94 
 
 
128 aa  232  1e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0265289  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0368  sulfur relay protein TusD/DsrE  85.94 
 
 
128 aa  232  1e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.3591e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3626  sulfur transfer complex subunit TusD  85.94 
 
 
128 aa  231  4e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.41818e-07  hitchhiker  0.000993351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4654  sulfur transfer complex subunit TusD  84.38 
 
 
128 aa  228  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.14483e-08  normal  0.0147781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3762  sulfur transfer complex subunit TusD  80.47 
 
 
128 aa  213  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.91404e-05  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3924  sulfur transfer complex subunit TusD  71.88 
 
 
131 aa  196  8e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.51286e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3681  sulfur transfer complex subunit TusD  71.88 
 
 
131 aa  196  8e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000326504  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0272  sulfur transfer complex subunit TusD  71.88 
 
 
131 aa  196  8e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4013  sulfur transfer complex subunit TusD  71.88 
 
 
129 aa  196  1e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0324388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3833  sulfur transfer complex subunit TusD  72.66 
 
 
129 aa  194  4e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4554  sulfur transfer complex subunit TusD  70.31 
 
 
129 aa  191  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.78436e-08  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0395  sulfur transfer complex subunit TusD  68.75 
 
 
129 aa  190  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0313  sulfur transfer complex subunit TusD  68.75 
 
 
129 aa  187  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000141741  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0489  intracellular sulfur reduction protein DsrE  57.72 
 
 
123 aa  155  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.233677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002294  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusD  57.03 
 
 
131 aa  153  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.90562e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00060  sulfur transfer complex subunit TusD  57.03 
 
 
131 aa  151  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3443  intracellular sulfur oxidation protein of DsrE family protein  53.12 
 
 
133 aa  138  2e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0125489  decreased coverage  2.56073e-05 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0307  sulfur transfer complex subunit TusD  51.56 
 
 
130 aa  137  4e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0180937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2768  sulfur transfer complex subunit TusD  52.34 
 
 
131 aa  135  3e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.18146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1925  sulfur transfer complex subunit TusD  50 
 
 
130 aa  133  7e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2474  sulfur relay protein TusD/DsrE  49.61 
 
 
129 aa  129  1e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000110001  hitchhiker  9.82729e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2059  DsrE family protein  46.46 
 
 
130 aa  127  5e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0188592  hitchhiker  0.000335265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1972  DsrE family protein  46.46 
 
 
130 aa  127  7e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.73125e-05  normal  0.68852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2004  DsrE family protein  45.67 
 
 
130 aa  125  2e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2110  DsrE family protein  47.24 
 
 
129 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000251046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2376  dsrE-related protein  44.88 
 
 
130 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2002  DsrE family protein  46.46 
 
 
129 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.24121e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2135  DsrE family protein  45.67 
 
 
129 aa  119  2e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293804  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  46.09 
 
 
119 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2187  sulfur relay protein TusD/DsrE  42.97 
 
 
130 aa  115  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2200  sulfur relay protein TusD/DsrE  43.31 
 
 
129 aa  115  2e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.31286e-08  normal  0.0885071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1781  DsrE-related protein  45.24 
 
 
139 aa  114  4e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111826  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2206  DsrE family protein  42.52 
 
 
129 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.46289e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2314  DsrE family protein  42.52 
 
 
129 aa  113  8e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.95076e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2165  DsrE family protein  41.73 
 
 
129 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.84958e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1803  DsrE family protein  42.31 
 
 
129 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1635  sulfur transfer complex subunit TusD  42.06 
 
 
126 aa  111  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1808  DsrE-like protein  43.31 
 
 
138 aa  110  8e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.48316e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1655  DsrE family protein  46.09 
 
 
119 aa  109  1e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2015  DsrE family protein  43.31 
 
 
129 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.23098e-07  hitchhiker  0.00302042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1519  DsrE family protein  40.62 
 
 
136 aa  108  4e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3397  sulfur transfer complex subunit TusD  42.97 
 
 
130 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.452785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1840  sulfur transfer complex subunit TusD  42.97 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000217326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3993  sulfur transfer complex subunit TusD  42.97 
 
 
130 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0220527  hitchhiker  0.0053466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3247  DsrE family protein  38.76 
 
 
130 aa  104  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.53566e-07  hitchhiker  1.80426e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3598  sulfur transfer complex subunit TusD  42.19 
 
 
130 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.276941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2483  DsrE protein  39.84 
 
 
119 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554665  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30400  sulfur transfer complex subunit TusD  42.19 
 
 
131 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2603  sulfur transfer complex subunit TusD  41.41 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2452  DsrE-like protein  41.27 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  2.23621e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3168  sulfur transfer complex subunit TusD  39.84 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209612  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28120  sulfur transfer complex subunit TusD  42.19 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2377  sulfur transfer complex subunit TusD  41.41 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278614  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3338  DsrE family protein  40.62 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1952  DsrE protein  33.59 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0266729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0132  DsrE family protein  32.03 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  6.91422e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1853  sulfur relay protein TusD/DsrE  33.85 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.0757641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  33.59 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0040  DsrE protein  32.81 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.5054  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0699  sulfur relay protein TusD/DsrE  32.81 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.187846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1704  DsrE family protein  33.59 
 
 
118 aa  84.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  7.86463e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1331  intracellular sulfur oxidation protein DsrE  36.92 
 
 
123 aa  82.8  1e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2317  sulfur relay protein TusD/DsrE  32.81 
 
 
119 aa  82.4  2e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0228723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2349  putative sulfur oxidation protein DsrE  37.6 
 
 
122 aa  82.4  2e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0286329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3575  sulfur transfer complex subunit TusD  38.78 
 
 
140 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0977  DsrE family protein  34.45 
 
 
136 aa  70.1  1e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  9.57329e-08 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1218  DsrE-like protein  34 
 
 
143 aa  67  8e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725713 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1174  DsrE-like protein  35.48 
 
 
143 aa  66.2  1e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0013044  hitchhiker  0.000454083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02104  sulfur relay protein TusB/DsrE  39.73 
 
 
123 aa  58.9  2e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.25154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  26.56 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1814  DsrE family protein  24.22 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  3.75732e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1760  DsrE family protein  24.22 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.00151e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  26.15 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  24.22 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>