75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3646 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3646  sulfur relay protein TusC  100 
 
 
118 aa  240  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.15464e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3647  sulfur relay protein TusC  100 
 
 
118 aa  240  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.33415e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3755  sulfur relay protein TusC  100 
 
 
118 aa  240  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0243963  normal  0.0807974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3818  sulfur relay protein TusC  100 
 
 
118 aa  240  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  8.2368e-05  normal  0.881738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3720  sulfur relay protein TusC  100 
 
 
118 aa  240  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  5.69521e-06  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4653  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
119 aa  202  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.51233e-09  decreased coverage  0.00984076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3625  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
119 aa  200  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.32932e-08  hitchhiker  0.000966126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0369  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
119 aa  200  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.31673e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0369  sulfur relay protein TusC/DsrF  84.03 
 
 
119 aa  200  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.99316e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3718  sulfur relay protein TusC  83.19 
 
 
119 aa  198  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.63718e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3540  sulfur relay protein TusC  83.19 
 
 
119 aa  198  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.90138e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03195  hypothetical protein  83.19 
 
 
119 aa  198  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.6186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03146  hypothetical protein  83.19 
 
 
119 aa  198  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.75023e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3813  sulfur relay protein TusC  83.19 
 
 
119 aa  197  4e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.46235e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3761  sulfur relay protein TusC  65.55 
 
 
119 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.07617e-06  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0273  sulfur relay protein TusC  61.86 
 
 
121 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000969658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0314  sulfur relay protein TusC  65.55 
 
 
119 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000155532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3923  sulfur relay protein TusC  61.86 
 
 
121 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.67034e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3680  sulfur relay protein TusC  61.86 
 
 
121 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.1238e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4553  sulfur relay protein TusC  62.18 
 
 
119 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.75116e-08  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0396  sulfur relay protein TusC  60.5 
 
 
119 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00209341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4012  sulfur relay protein TusC  56.3 
 
 
119 aa  143  7e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0119239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3832  sulfur relay protein TusC  61.34 
 
 
119 aa  131  2e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00059  sulfur oxidation protein dsrF  49.15 
 
 
118 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002295  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusC  47.46 
 
 
118 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.67918e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2769  hypothetical protein  46.61 
 
 
118 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.35142e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0308  intracellular sulfur oxidation protein DsrF  42.37 
 
 
118 aa  114  4e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00506784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1634  sulfur relay protein TusC  44.17 
 
 
120 aa  113  8e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3442  intraceullular sulfur oxidation protein of DsrE family protein  43.59 
 
 
120 aa  110  4e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00176558  decreased coverage  2.58214e-05 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0490  intracellular reduction protein DsrF  40.34 
 
 
119 aa  104  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2453  DsrE-like protein  39.83 
 
 
118 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.3855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2475  sulfur relay protein TusC/DsrF  38.98 
 
 
118 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.7819e-05  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2134  DsrE family protein  37.29 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2109  DsrE family protein  36.44 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.80697e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2315  DsrE family protein  35.59 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.69455e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2207  DsrE family protein  35.59 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.32084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1802  DsrE family protein  35.59 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2199  sulfur relay protein TusC/DsrF  35.59 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.09085e-08  normal  0.0885071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2164  DsrE family protein  35.59 
 
 
118 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.49847e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1656  DsrE family protein  36.44 
 
 
128 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2016  DsrE family protein  42.57 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.18416e-07  hitchhiker  0.00293118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2377  hypothetical protein  37.29 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1807  DsrE-like protein  40.82 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.42115e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28130  sulfur relay protein TusC  40 
 
 
119 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1780  hypothetical protein  36.97 
 
 
118 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129474  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2003  DsrE family protein  33.9 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.82885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2058  DsrE family protein  34.75 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0573181  hitchhiker  0.000337612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2005  DsrE family protein  34.75 
 
 
118 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0519969  hitchhiker  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1971  DsrE family protein  34.75 
 
 
118 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.39065e-05  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0041  DsrF protein  33.9 
 
 
122 aa  83.2  1e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.630968  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2348  putative sulfur oxidation protein DsrF  33.04 
 
 
121 aa  77.4  7e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0587865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2482  DsrF protein  27.97 
 
 
131 aa  77  9e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.067971  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1951  DsrF protein  34.19 
 
 
123 aa  76.6  1e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0170075  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2316  sulfur relay protein TusC/DsrF  33.33 
 
 
129 aa  75.1  3e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0137343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1954  DsrE family protein  32.2 
 
 
130 aa  74.3  5e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.414828  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1852  sulfur relay protein TusC/DsrF  33.62 
 
 
121 aa  73.2  1e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000304712  normal  0.0727441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2602  sulfur relay protein TusC  34.19 
 
 
119 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0034  sulfur relay protein TusC/DsrF  31.36 
 
 
125 aa  71.2  4e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30390  sulfur relay protein TusC  33.04 
 
 
119 aa  71.6  4e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0133  DsrE family protein  32.2 
 
 
129 aa  70.9  5e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  1.09278e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3599  sulfur relay protein TusC  31.3 
 
 
119 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2188  sulfur relay protein TusC/DsrF  29.66 
 
 
130 aa  69.3  2e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.946925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3169  sulfur relay protein TusC  35.63 
 
 
120 aa  67.4  6e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.263841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3994  sulfur relay protein TusC  31.3 
 
 
119 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0906893  hitchhiker  0.00530974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1839  sulfur relay protein TusC  31.3 
 
 
119 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000201161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1924  DsrE-like protein  30.36 
 
 
126 aa  65.5  3e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.514773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0700  sulfur relay protein TusC/DsrF  35.23 
 
 
123 aa  65.1  3e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.137823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3398  sulfur relay protein TusC  31.3 
 
 
119 aa  63.9  7e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.451628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3339  DsrF family protein  35.63 
 
 
120 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2378  sulfur relay protein TusC  29.57 
 
 
119 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.643649  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1705  DsrE family protein  29.25 
 
 
133 aa  57.8  5e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.95372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3576  sulfur relay protein TusC  27.83 
 
 
118 aa  55.1  3e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1520  DsrE family protein  28.28 
 
 
116 aa  47.4  6e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.435387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02105  DsrE family protein  24.18 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0434  DsrE-like protein  26.14 
 
 
116 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>