290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3618 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
59 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
59 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
59 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
59 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
59 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  98.31 
 
 
59 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  2.43699e-06 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.88891e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.58772e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.35964e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  8.4288e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  98.31 
 
 
59 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  96.61 
 
 
59 aa  117  4e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  98.31 
 
 
59 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  96.61 
 
 
61 aa  116  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  91.53 
 
 
59 aa  113  9e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.79323e-06  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  89.83 
 
 
59 aa  112  2e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.09135e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  89.83 
 
 
59 aa  112  2e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.35954e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  84.75 
 
 
59 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.64159e-09  unclonable  7.31174e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  78.95 
 
 
60 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  1.26926e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  78.95 
 
 
60 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  7.99433e-10  hitchhiker  9.56055e-10 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  79.66 
 
 
60 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.04117e-05  unclonable  8.20737e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.26837e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.14653e-05  hitchhiker  9.35583e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.15518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  2.00607e-12 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.17278e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  77.19 
 
 
60 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.91615e-05  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  72.88 
 
 
61 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  78.57 
 
 
58 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.99402e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  78.57 
 
 
58 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  76.79 
 
 
58 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.60316e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  75.44 
 
 
62 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.87774e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  71.19 
 
 
60 aa  94.4  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  76.79 
 
 
60 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.58011e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  80 
 
 
58 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  7.5211e-08 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  74.58 
 
 
62 aa  91.3  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 
59 aa  91.3  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  75.44 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  71.43 
 
 
59 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0444  50S ribosomal protein L30  68.42 
 
 
59 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.47564e-07  hitchhiker  9.3478e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  67.24 
 
 
62 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  4.91198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  66.07 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  65.45 
 
 
61 aa  76.3  2e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21281e-06  unclonable  2.08218e-12 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 
59 aa  74.7  4e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  61.11 
 
 
65 aa  74.3  5e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  8.59668e-12  hitchhiker  2.07421e-06 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  58.93 
 
 
60 aa  72.8  1e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0505  50S ribosomal protein L30  60 
 
 
58 aa  72.8  1e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00113735  normal  0.0573997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  60 
 
 
58 aa  72.8  1e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  1.22641e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0472  50S ribosomal protein L30  60 
 
 
58 aa  72.8  1e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291193  hitchhiker  2.69713e-06 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 
59 aa  73.6  1e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3891  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 
59 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.9695e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 
58 aa  71.6  4e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  54.39 
 
 
62 aa  71.2  4e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  61.4 
 
 
61 aa  70.9  6e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5061  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
58 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  9.319e-08  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4731  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
58 aa  70.5  7e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000152085  normal  0.600234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 
60 aa  68.9  2e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2354  ribosomal protein L30  57.89 
 
 
61 aa  68.2  4e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4530  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
58 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0644  ribosomal protein L30  54.55 
 
 
58 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  55.93 
 
 
61 aa  67.8  5e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  54.39 
 
 
65 aa  67.4  6e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
58 aa  67  9e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
58 aa  67  9e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  55.93 
 
 
62 aa  66.6  1e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 
60 aa  66.6  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  59.32 
 
 
60 aa  65.9  2e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
60 aa  65.9  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
60 aa  65.5  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
60 aa  65.5  3e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  4.05636e-06 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
63 aa  64.7  4e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.7  5e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  4.87608e-06  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.7  5e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.7  5e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.7  5e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.7  5e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  64.7  5e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  63.9  6e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  5.85179e-05  hitchhiker  1.33791e-11 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  63.9  6e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  60 
 
 
59 aa  63.5  8e-10  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  63.5  9e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
57 aa  63.5  9e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
57 aa  63.5  9e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>