More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3613 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
129 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
129 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
129 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
129 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
129 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  99.22 
 
 
129 aa  262  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  98.45 
 
 
129 aa  261  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  98.45 
 
 
129 aa  261  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  98.45 
 
 
129 aa  261  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  98.45 
 
 
129 aa  261  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  98.45 
 
 
129 aa  261  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  97.67 
 
 
129 aa  258  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  97.67 
 
 
129 aa  258  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  97.67 
 
 
129 aa  258  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  249  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  91.47 
 
 
129 aa  247  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  91.47 
 
 
129 aa  247  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  91.47 
 
 
129 aa  247  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  90.7 
 
 
129 aa  244  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  89.15 
 
 
129 aa  241  3e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  85.27 
 
 
129 aa  232  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  85.38 
 
 
130 aa  228  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  227  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  227  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  227  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  83.85 
 
 
130 aa  226  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  226  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  226  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  225  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  224  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  223  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  75.97 
 
 
129 aa  217  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0254  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4033  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372672  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0222  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000441654  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0219  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4147  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3736  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000151104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0222  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000236746  unclonable  0.0000000000190612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0217  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0222  30S ribosomal protein S11  84.62 
 
 
130 aa  216  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251222  unclonable  0.0000000000422157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 
129 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 
129 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 
129 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 
129 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 
129 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 
129 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  214  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 
129 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2612  30S ribosomal protein S11  87.6 
 
 
129 aa  213  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417638  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3501  30S ribosomal protein S11  87.6 
 
 
129 aa  213  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000656378  hitchhiker  0.0000000781676 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0345  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 
129 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000250973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0444  30S ribosomal protein S11  80.8 
 
 
128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
129 aa  209  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  74.81 
 
 
131 aa  208  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  75.59 
 
 
130 aa  208  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  76.15 
 
 
130 aa  208  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0742  30S ribosomal protein S11  80.62 
 
 
129 aa  207  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0701774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  76.19 
 
 
127 aa  204  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  73.81 
 
 
135 aa  203  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  83.93 
 
 
130 aa  203  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2146  30S ribosomal protein S11  75.19 
 
 
129 aa  202  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 
132 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  72.18 
 
 
133 aa  201  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 
129 aa  201  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 
129 aa  201  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  71.43 
 
 
133 aa  200  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  82.14 
 
 
131 aa  200  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  69.4 
 
 
134 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  70.15 
 
 
134 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  69.4 
 
 
134 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  69.4 
 
 
134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2349  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  69.4 
 
 
134 aa  197  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 
133 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
133 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 
133 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>