More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3603 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  100 
 
 
169 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  100 
 
 
169 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  100 
 
 
169 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  100 
 
 
169 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  100 
 
 
169 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  98.22 
 
 
169 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  98.22 
 
 
169 aa  332  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  98.22 
 
 
169 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  98.22 
 
 
169 aa  332  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  98.22 
 
 
169 aa  332  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  98.22 
 
 
169 aa  332  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  98.22 
 
 
169 aa  332  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  97.63 
 
 
169 aa  330  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  97.63 
 
 
169 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  97.04 
 
 
169 aa  328  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  89.35 
 
 
170 aa  313  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  89.35 
 
 
170 aa  313  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  89.35 
 
 
170 aa  313  6e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  90.53 
 
 
169 aa  310  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  91.72 
 
 
169 aa  310  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  88.1 
 
 
170 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  86.98 
 
 
169 aa  299  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  84.02 
 
 
170 aa  288  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  84.02 
 
 
170 aa  286  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  70.83 
 
 
169 aa  254  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  72.02 
 
 
172 aa  254  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  72.02 
 
 
172 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  67.68 
 
 
167 aa  236  2e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  68.18 
 
 
169 aa  227  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  64.5 
 
 
169 aa  221  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  63.69 
 
 
170 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  63.41 
 
 
177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  64.02 
 
 
167 aa  217  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  60.95 
 
 
169 aa  217  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  61.9 
 
 
199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  62.42 
 
 
178 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  61.31 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  61.31 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  61.31 
 
 
168 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  61.31 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  61.31 
 
 
168 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  61.31 
 
 
168 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  61.31 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  59.52 
 
 
170 aa  210  7e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  60.12 
 
 
168 aa  209  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  58.93 
 
 
170 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  59.64 
 
 
167 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  64.07 
 
 
178 aa  207  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  60.98 
 
 
169 aa  206  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  60 
 
 
179 aa  206  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  60.12 
 
 
170 aa  206  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  59.17 
 
 
170 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  61.21 
 
 
170 aa  202  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  58.79 
 
 
179 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  58.79 
 
 
167 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  58.79 
 
 
179 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  60.48 
 
 
169 aa  201  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  57.58 
 
 
181 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  59.63 
 
 
177 aa  200  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  59.51 
 
 
167 aa  200  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  57.74 
 
 
168 aa  200  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  58.18 
 
 
216 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  57.67 
 
 
167 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  58.18 
 
 
167 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  58.18 
 
 
167 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  58.93 
 
 
168 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  58.18 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  59.39 
 
 
168 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  57.67 
 
 
167 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0024  peptide deformylase  57.14 
 
 
188 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  56.71 
 
 
191 aa  198  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  57.58 
 
 
167 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  58.08 
 
 
167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  56.97 
 
 
167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  57.14 
 
 
168 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  58.24 
 
 
170 aa  197  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  58.24 
 
 
170 aa  197  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  56.97 
 
 
167 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  56.21 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  58.79 
 
 
171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  56.36 
 
 
167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  56.36 
 
 
167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  56.97 
 
 
167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  58.79 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  57.74 
 
 
168 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  56.71 
 
 
167 aa  195  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  57.74 
 
 
168 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  59.88 
 
 
168 aa  193  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  56.97 
 
 
178 aa  192  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  56.97 
 
 
171 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  54.76 
 
 
168 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  58.02 
 
 
169 aa  191  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  56.55 
 
 
168 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  55.56 
 
 
171 aa  191  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  51.19 
 
 
170 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  51.19 
 
 
170 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  54.22 
 
 
181 aa  191  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  58.02 
 
 
171 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  58.54 
 
 
167 aa  189  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  56.79 
 
 
171 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>