35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3596 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3596    100 
 
 		 852 bp  1689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3766    98.92 
 
 		 555 bp  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000123741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3703    99.46 
 
 		 555 bp  1076    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000527174  normal  0.0126385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3595    98.92 
 
 		 555 bp  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000374403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3668    98.74 
 
 		 555 bp  1045    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000136044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0271    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000169851  normal  0.189693 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3593    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0290    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4508    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000134534  normal  0.0130242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3701    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000151776  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4510    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000429759  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4421    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0271    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  normal  0.568002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3764    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000366731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4584    100 
 
 		 123 bp  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000031189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0287    99.19 
 
 		 123 bp  236  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000805028  normal  0.284432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0276    99.19 
 
 		 123 bp  236  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000427815  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3667  hypothetical protein  100 
 
 		 117 bp  232  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000487967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3702  hypothetical protein  100 
 
 		 117 bp  232  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000158002  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3594  hypothetical protein  99.15 
 
 		 117 bp  224  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000579961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  78.97 
 
 		 555 bp  135  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  78.97 
 
 		 555 bp  135  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  84.58 
 
 		 882 bp  129  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  78.74 
 
 		 555 bp  127  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  78.74 
 
 		 555 bp  127  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  78.74 
 
 		 771 bp  127  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  78.74 
 
 		 555 bp  127  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  78.74 
 
 		 771 bp  127  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  78.74 
 
 		 555 bp  127  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  86.75 
 
 		 555 bp  77.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  81.34 
 
 		 543 bp  67.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  81.34 
 
 		 543 bp  67.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  81.34 
 
 		 543 bp  67.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  88.89 
 
 		 555 bp  60  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3497  hypothetical protein  100 
 
 		 138 bp  60  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>