35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3596 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3595    98.92 
 
 
555 bp  1053  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  3.74403e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3596    100 
 
 
852 bp  1689  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  8.08092e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3703    99.46 
 
 
555 bp  1076  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  5.27174e-05  normal  0.0126385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3766    98.92 
 
 
555 bp  1053  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.23741e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3668    98.74 
 
 
555 bp  1045  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000136044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0271    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000169851  normal  0.189693 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4510    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  4.29759e-06  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3593    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  5.68709e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4508    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.34534e-05  normal  0.0130242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3701    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.51776e-05  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0290    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.69803e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4584    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  3.1189e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3764    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  3.66731e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0271    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  3.4857e-06  normal  0.568002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4421    100 
 
 
123 bp  244  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.36288e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0276    99.19 
 
 
123 bp  236  8e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  4.27815e-08  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0287    99.19 
 
 
123 bp  236  8e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  8.05028e-06  normal  0.284432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3667  hypothetical protein  100 
 
 
117 bp  232  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  4.87967e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3702  hypothetical protein  100 
 
 
117 bp  232  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.58002e-05  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3594  hypothetical protein  99.15 
 
 
117 bp  224  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  5.79961e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  78.97 
 
 
555 bp  135  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.54067e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  78.97 
 
 
555 bp  135  2e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.28421e-08  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  84.58 
 
 
882 bp  129  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.74593e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  78.74 
 
 
555 bp  127  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.50407e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  78.74 
 
 
555 bp  127  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.2792e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  78.74 
 
 
555 bp  127  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.21267e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  78.74 
 
 
771 bp  127  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  78.74 
 
 
555 bp  127  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.08739e-09  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  78.74 
 
 
771 bp  127  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.98302e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  86.75 
 
 
555 bp  77.8  5e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  3.68449e-06  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  81.34 
 
 
543 bp  67.9  4e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.87366e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  81.34 
 
 
543 bp  67.9  4e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.2748e-08  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  81.34 
 
 
543 bp  67.9  4e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.17644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  88.89 
 
 
555 bp  60  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.49932e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3497  hypothetical protein  100 
 
 
138 bp  60  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>