More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3566 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  1.55968e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  98.85 
 
 
347 aa  687  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.73686e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  1.54905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.18605e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  91.64 
 
 
347 aa  646  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  93.08 
 
 
347 aa  654  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  6.4313e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.1141e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  97.12 
 
 
347 aa  675  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  99.14 
 
 
347 aa  691  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  98.85 
 
 
347 aa  690  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  89.34 
 
 
347 aa  635  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.47765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  99.14 
 
 
347 aa  690  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.07307e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  6.01391e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.07844e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.38726e-07  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.36359e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  696  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  6.17813e-05  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  99.14 
 
 
347 aa  690  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.38277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  89.91 
 
 
347 aa  636  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.19217e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 
347 aa  696  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.27973e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  91.64 
 
 
347 aa  646  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.33641e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  92.8 
 
 
347 aa  631  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  89.91 
 
 
347 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.9673e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  89.94 
 
 
349 aa  627  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.06946e-05  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  89.94 
 
 
349 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  7.01456e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  89.66 
 
 
349 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.43177e-07  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4561  rod shape-determining protein MreB  89.91 
 
 
347 aa  617  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 
349 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.91443e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 
349 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.45532e-07  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 
349 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.19946e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 
349 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.18886e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 
349 aa  613  1e-174  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  4.9309e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 
349 aa  613  1e-174  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.92935e-07  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 
349 aa  613  1e-174  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.80554e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 
349 aa  613  1e-174  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.32389e-06  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 
349 aa  612  1e-174  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3334  rod shape-determining protein MreB  90.49 
 
 
348 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.27845e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  89.94 
 
 
349 aa  607  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.26028e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  90.23 
 
 
349 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.61982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 
349 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.95514e-08  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  83.29 
 
 
347 aa  591  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  79.83 
 
 
347 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  80.4 
 
 
345 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  80.69 
 
 
345 aa  564  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  80.69 
 
 
345 aa  564  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  80.69 
 
 
345 aa  564  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  80.4 
 
 
345 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1127  rod shape-determining protein MreB  80.52 
 
 
351 aa  567  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  2.27657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  80.4 
 
 
345 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  80.4 
 
 
345 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  78.39 
 
 
347 aa  562  1e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  80.4 
 
 
345 aa  563  1e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  79.83 
 
 
345 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  79.83 
 
 
345 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  77.91 
 
 
347 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  78.39 
 
 
345 aa  555  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  77.3 
 
 
348 aa  555  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  77.81 
 
 
345 aa  554  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  78.39 
 
 
345 aa  555  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  78.67 
 
 
345 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  77.01 
 
 
348 aa  548  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  78.1 
 
 
347 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  9.92624e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  77.46 
 
 
347 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  77.59 
 
 
352 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  77.46 
 
 
347 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  77.59 
 
 
352 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  3.44491e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0514  rod shape-determining protein MreB  79.89 
 
 
348 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  76.15 
 
 
348 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  75.22 
 
 
345 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1937  rod shape-determining protein MreB  74.35 
 
 
347 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  8.14712e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  71.92 
 
 
347 aa  515  1e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3192  rod shape-determining protein MreB  77.84 
 
 
343 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  4.67509e-13  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1630  rod shape-determining protein MreB  72.83 
 
 
348 aa  507  1e-142  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  74.1 
 
 
347 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  1.88341e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  74.1 
 
 
348 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  73.67 
 
 
347 aa  491  1e-138  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  73.51 
 
 
352 aa  491  1e-138  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  72 
 
 
347 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  72.29 
 
 
347 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  72.29 
 
 
347 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  72.29 
 
 
347 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  72 
 
 
347 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0326  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4398  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179044  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  71.14 
 
 
347 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  73.35 
 
 
347 aa  484  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>