150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3379 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  99.55 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  99.55 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  99.55 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  99.55 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  88.29 
 
 
222 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  65.55 
 
 
219 aa  278  5e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  61.4 
 
 
218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  59.47 
 
 
221 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  59.45 
 
 
220 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  55.51 
 
 
228 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  49.54 
 
 
219 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  45.79 
 
 
213 aa  190  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.27 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.72 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.82 
 
 
220 aa  158  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  41.23 
 
 
203 aa  147  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 
203 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 
203 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  40 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  29.52 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  37.14 
 
 
200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  30.59 
 
 
223 aa  106  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.57 
 
 
223 aa  94.7  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.83 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  28.12 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  27.68 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
202 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  32.83 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  32.32 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.34 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.54 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.54 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.54 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.25 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.09 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.72 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.72 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.72 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.72 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.72 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.73 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.66 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.78 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.82 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  26.39 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.85 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.49 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.17 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.05 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.27 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 
218 aa  61.6  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 
207 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.22 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.36 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.74 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  26.18 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  24.34 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.82 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>