More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3295 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  100 
 
 
280 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  99.64 
 
 
280 aa  563  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  99.64 
 
 
280 aa  563  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  99.64 
 
 
280 aa  563  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  72.3 
 
 
280 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  72.3 
 
 
280 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  72.66 
 
 
280 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  53.33 
 
 
274 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  44.48 
 
 
293 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  44.48 
 
 
293 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  44.48 
 
 
293 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  44.48 
 
 
293 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  44.48 
 
 
293 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.48 
 
 
293 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  43.68 
 
 
293 aa  189  6e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  37.68 
 
 
302 aa  184  2e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  37.68 
 
 
305 aa  184  2e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  39.33 
 
 
281 aa  179  3e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  37.45 
 
 
288 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  38.58 
 
 
280 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  41 
 
 
281 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.94 
 
 
275 aa  168  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.11 
 
 
294 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  35.31 
 
 
318 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  35.83 
 
 
379 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  35.18 
 
 
318 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  35.18 
 
 
318 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  36.04 
 
 
327 aa  153  3e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  35.43 
 
 
341 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  35.41 
 
 
325 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  35.53 
 
 
324 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 
323 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  35.74 
 
 
276 aa  147  1e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  37.5 
 
 
283 aa  148  1e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  36.73 
 
 
286 aa  147  2e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  35.2 
 
 
324 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  34.53 
 
 
318 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  34.2 
 
 
320 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 
324 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  34.98 
 
 
282 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 
324 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  34.54 
 
 
323 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  34.54 
 
 
325 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  33.01 
 
 
325 aa  141  1e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  34.98 
 
 
282 aa  140  2e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  37.54 
 
 
281 aa  140  2e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  39.15 
 
 
278 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  34.11 
 
 
320 aa  139  8e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  35.9 
 
 
278 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  36.68 
 
 
310 aa  136  3e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  37.41 
 
 
293 aa  136  3e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  39.35 
 
 
280 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 
292 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 
292 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.07 
 
 
269 aa  134  1e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.25 
 
 
286 aa  134  1e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.27 
 
 
291 aa  134  2e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  39.08 
 
 
277 aa  134  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 
306 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  35.23 
 
 
406 aa  133  4e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  34.81 
 
 
301 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.27 
 
 
290 aa  131  1e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  35.46 
 
 
271 aa  131  1e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 
271 aa  131  1e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  36.75 
 
 
278 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  35.77 
 
 
286 aa  129  4e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  36.17 
 
 
288 aa  129  4e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  39.43 
 
 
275 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  36.75 
 
 
283 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 
272 aa  127  2e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 
272 aa  127  2e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.04 
 
 
279 aa  127  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 
272 aa  127  2e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.5 
 
 
296 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.65 
 
 
306 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.71 
 
 
274 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 
330 aa  126  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0459  HpcH/HpaI aldolase  30.86 
 
 
286 aa  126  4e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.255492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.3 
 
 
306 aa  126  4e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.38772e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  33.81 
 
 
267 aa  126  4e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3027  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 
287 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  32.44 
 
 
303 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  36.4 
 
 
278 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  33.57 
 
 
289 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  33.92 
 
 
283 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  33.93 
 
 
285 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  32.63 
 
 
297 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
287 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  33.95 
 
 
282 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  32.48 
 
 
282 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  32.36 
 
 
292 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.69 
 
 
282 aa  122  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  30.1 
 
 
306 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  32.34 
 
 
292 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  31.83 
 
 
316 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 
303 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  32.76 
 
 
293 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  34.08 
 
 
270 aa  121  1e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  32.58 
 
 
270 aa  121  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  33.93 
 
 
285 aa  121  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>