More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3150 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  99.63 
 
 
268 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  100 
 
 
268 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  99.63 
 
 
268 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  99.63 
 
 
268 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  99.63 
 
 
268 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  93.63 
 
 
268 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  93.63 
 
 
268 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  93.63 
 
 
268 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  93.63 
 
 
268 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  93.63 
 
 
268 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  93.63 
 
 
268 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  93.63 
 
 
268 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  92.45 
 
 
266 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  92.08 
 
 
266 aa  504  1e-142  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3258  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  92.13 
 
 
268 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  82.4 
 
 
268 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.33838e-05  hitchhiker  5.27658e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  80.22 
 
 
275 aa  458  1e-128  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  79.85 
 
 
275 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  79.85 
 
 
275 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  79.78 
 
 
275 aa  448  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  79.03 
 
 
277 aa  444  1e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  78.57 
 
 
270 aa  446  1e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  77.07 
 
 
272 aa  438  1e-122  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  66.67 
 
 
269 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  66.67 
 
 
269 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  66.28 
 
 
273 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0688  hypothetical protein  66.16 
 
 
271 aa  358  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0324843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.99 
 
 
259 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35994e-07 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.85 
 
 
261 aa  346  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  60.08 
 
 
263 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  63.4 
 
 
270 aa  337  1e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  59.54 
 
 
277 aa  334  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4150  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.42 
 
 
271 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0818457  normal  0.243283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4007  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  61.8 
 
 
271 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  hitchhiker  5.36443e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.26 
 
 
266 aa  332  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.266567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.17 
 
 
267 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.3 
 
 
272 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0542286  hitchhiker  4.83539e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0763  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.3 
 
 
272 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.568059  unclonable  2.13544e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  57.25 
 
 
264 aa  321  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0780  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.69 
 
 
270 aa  320  1e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0735  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.92 
 
 
277 aa  320  1e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  decreased coverage  3.65596e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3895  HesA/MoeB/ThiF family protein  61.3 
 
 
267 aa  320  2e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60 
 
 
269 aa  319  2e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60 
 
 
269 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65754  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60 
 
 
269 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.456786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60 
 
 
269 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859159  hitchhiker  1.17233e-10 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.69 
 
 
268 aa  316  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  57.25 
 
 
255 aa  309  3e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01865  HesA/MoeB/ThiF family protein  57.54 
 
 
258 aa  296  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  53.53 
 
 
272 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  55.29 
 
 
276 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1136  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.22 
 
 
269 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.761745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.22 
 
 
269 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.22 
 
 
271 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.22 
 
 
269 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49350  hypothetical protein  59.2 
 
 
270 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0144415  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.55 
 
 
286 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  58 
 
 
270 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  57.42 
 
 
270 aa  282  4e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  53.2 
 
 
255 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  49.65 
 
 
300 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.41 
 
 
285 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  53.23 
 
 
285 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1090  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  55.29 
 
 
270 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1333  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  56.47 
 
 
276 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3064  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.03 
 
 
269 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.12 
 
 
300 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.12 
 
 
300 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.29 
 
 
295 aa  274  1e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  51.55 
 
 
302 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.82 
 
 
288 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.82 
 
 
288 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.82 
 
 
288 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.82 
 
 
288 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.82 
 
 
288 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.82 
 
 
341 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.82 
 
 
288 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.41 
 
 
288 aa  261  7e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.92 
 
 
285 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.56 
 
 
285 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.92 
 
 
285 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.36 
 
 
264 aa  257  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2895  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  56 
 
 
274 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.25 
 
 
285 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.85 
 
 
285 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.85 
 
 
285 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.85 
 
 
285 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3049  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  48.85 
 
 
270 aa  254  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.38 
 
 
274 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.35 
 
 
265 aa  234  1e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.18 
 
 
267 aa  233  2e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.18 
 
 
267 aa  233  2e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.88 
 
 
275 aa  231  7e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315425  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0884  molybdopterin biosynthesis protein  43.13 
 
 
276 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04809  molybdopterin biosynthesis protein  48.03 
 
 
276 aa  219  4e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.04 
 
 
265 aa  214  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.81 
 
 
296 aa  211  9e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.77 
 
 
264 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44 
 
 
247 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00531734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3397  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.29 
 
 
275 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.056672  normal  0.0184534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>