32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3097 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  100 
 
 
511 aa  1063  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.04629e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  95.69 
 
 
511 aa  1020  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  50.67 
 
 
523 aa  507  1e-142  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  51.16 
 
 
511 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  46.71 
 
 
508 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  45.33 
 
 
520 aa  446  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  45.53 
 
 
520 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  45.33 
 
 
520 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  47.11 
 
 
518 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  46.05 
 
 
518 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  43.59 
 
 
519 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.83 
 
 
539 aa  399  1e-110  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  41.33 
 
 
521 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  39.85 
 
 
529 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  38.91 
 
 
534 aa  355  8e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  39.75 
 
 
564 aa  353  3e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  39.41 
 
 
535 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  37.93 
 
 
534 aa  309  8e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  34.48 
 
 
528 aa  279  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.41283e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.14 
 
 
546 aa  270  6e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  32.99 
 
 
532 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  34.77 
 
 
534 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.53 
 
 
529 aa  246  7e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  32.94 
 
 
529 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.85 
 
 
560 aa  227  5e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.13 
 
 
555 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  25.35 
 
 
506 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  25.71 
 
 
502 aa  79.7  1e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.4 
 
 
502 aa  78.6  3e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  25.71 
 
 
502 aa  77  8e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.41 
 
 
525 aa  55.1  3e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  22.07 
 
 
488 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.359365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>