More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2799 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  99.81 
 
 		 514 aa  1066    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  100 
 
 		 514 aa  1067    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2820  DNA-binding transcriptional activator CadC  99.61 
 
 		 514 aa  1065    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0342818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2713  transcriptional activator CadC  97.67 
 
 		 395 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2758  DNA-binding transcriptional activator CadC  99.61 
 
 		 514 aa  1065    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00262539  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  58.88 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.88 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  58.88 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.88 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  58.88 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.88 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.88 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.69 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3769  DNA-binding transcriptional activator CadC  54.26 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000389639  normal  0.0128814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2716  transcriptional activator CadC  99.25 
 
 		 133 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2656  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.04 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002187  transcriptional activator of cad operon  27.08 
 
 		 522 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000411708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00207  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.44 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2494  DNA-binding transcriptional activator CadC  25.64 
 
 		 542 aa  140  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  35.39 
 
 		 717 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  27.09 
 
 		 772 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  26.52 
 
 		 774 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  34.62 
 
 		 1102 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 712 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  28.81 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  32.61 
 
 		 1089 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  33.57 
 
 		 1092 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  31.73 
 
 		 1074 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 1075 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3319  transcriptional regulatory protein-like protein  35.87 
 
 		 691 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.389048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  31.88 
 
 		 1089 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  31.88 
 
 		 1075 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.29 
 
 		 1063 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.29 
 
 		 1075 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 1080 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  28.5 
 
 		 729 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  31.45 
 
 		 711 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  31.88 
 
 		 1067 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  33.61 
 
 		 762 aa  67  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  34.41 
 
 		 693 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  36.36 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  36.08 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  30.69 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  31.15 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1712  transcriptional regulator, putative  32.04 
 
 		 507 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  39.51 
 
 		 711 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2898  cholera toxin transcriptional activator-like protein  35.24 
 
 		 282 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.398883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 954 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  29 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  31.19 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 1092 aa  60.1  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.67 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 245 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  34.23 
 
 		 1124 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  30.58 
 
 		 956 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  27.47 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  30.97 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0175  two-component response regulator  28 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  33.67 
 
 		 1131 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  44.74 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  36.26 
 
 		 946 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  28 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 928 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 1020 aa  57.4  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 239 aa  57  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 959 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  28.07 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6027  transcriptional regulator, CadC  32.95 
 
 		 188 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0284754  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1016  transcriptional regulator, CadC  31.73 
 
 		 250 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.483037  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  27 
 
 		 223 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0964  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 266 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 973 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0242  two-component regulator  27 
 
 		 223 aa  55.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20879  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0379  DNA-binding response regulator  27 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 239 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 235 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1569  winged helix family two component response transcriptional regulator  31.63 
 
 		 236 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000954897  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.19 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 239 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  26.19 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  26.19 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 239 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.63 
 
 		 906 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 239 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 239 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1603  DNA-binding response regulator  27 
 
 		 223 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  31 
 
 		 490 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0290  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 251 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  27.45 
 
 		 223 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 233 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  40.85 
 
 		 290 aa  53.9  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 601 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>