More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2659 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  98.38 
 
 
308 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  98.7 
 
 
308 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  98.7 
 
 
308 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  98.7 
 
 
308 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  79.87 
 
 
308 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  79.22 
 
 
308 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  79.55 
 
 
308 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  79.22 
 
 
308 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  79.22 
 
 
308 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  80.13 
 
 
311 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  79.22 
 
 
308 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  79.55 
 
 
308 aa  477  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  79.22 
 
 
308 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  79.55 
 
 
308 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  65.74 
 
 
306 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
300 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  50.69 
 
 
300 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
300 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  52.6 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
300 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
300 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.86 
 
 
304 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  51.15 
 
 
305 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
300 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
301 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  52.07 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  47.24 
 
 
298 aa  279  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
300 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
300 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2537  transcription regulator transcription regulator protein  49.83 
 
 
297 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2812  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 
297 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260123  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2406  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 
298 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
309 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
310 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  35.84 
 
 
300 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2261  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
327 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015207  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
312 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 
323 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
313 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
306 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
305 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4699  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
340 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254912  normal  0.0113206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.88 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
297 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 
302 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  36.01 
 
 
297 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
304 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
305 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
305 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
317 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 
317 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
317 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 
317 aa  165  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
307 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
307 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
299 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
307 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
307 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
307 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
313 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
316 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
298 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
300 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
298 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 
305 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
304 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
298 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
298 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
328 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
322 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>