More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2455 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  70.27 
 
 		 518 aa  801    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  70.46 
 
 		 518 aa  804    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  99.03 
 
 		 518 aa  1061    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1071    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  66.01 
 
 		 518 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  99.23 
 
 		 518 aa  1065    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  70.66 
 
 		 518 aa  807    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  70.27 
 
 		 518 aa  801    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  71.11 
 
 		 497 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  70.85 
 
 		 518 aa  806    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  70.46 
 
 		 518 aa  804    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  70.66 
 
 		 518 aa  805    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  99.42 
 
 		 518 aa  1067    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  70.46 
 
 		 518 aa  804    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  99.03 
 
 		 518 aa  1063    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  42.41 
 
 		 528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  42.94 
 
 		 526 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  42.94 
 
 		 526 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.11 
 
 		 533 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.11 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.11 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  32.82 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.06 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  34.15 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  35.56 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  35.2 
 
 		 506 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  34.98 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  34.38 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  30.21 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  30.21 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  35.23 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.21 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  30.21 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.21 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  32.84 
 
 		 535 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.87 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  31.58 
 
 		 534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.73 
 
 		 532 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  33.33 
 
 		 519 aa  223  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  32.52 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  31.2 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  32.13 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  32.59 
 
 		 511 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  27.85 
 
 		 526 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  39.58 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  41.73 
 
 		 516 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.22 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  31.47 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.44 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  41.2 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  41.34 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  30.27 
 
 		 521 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  30.27 
 
 		 507 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  30.27 
 
 		 507 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.27 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  37.12 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  30.27 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.04 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  35.97 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 528 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 		 528 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  40.32 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 		 528 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  30.92 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  38.31 
 
 		 525 aa  181  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  180  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5670  diguanylate phosphodiesterase  27.71 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  38.87 
 
 		 528 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  29.14 
 
 		 534 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  29.14 
 
 		 534 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  29.14 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  29.48 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.71 
 
 		 743 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1385  signal transduction protein containing sensor and EAL domains-like protein  39.62 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.14 
 
 		 917 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.93 
 
 		 362 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3445  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.09 
 
 		 1094 aa  163  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.95 
 
 		 862 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2992  diguanylate phosphodiesterase  28.73 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.51 
 
 		 362 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  36.51 
 
 		 362 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  36.51 
 
 		 362 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1614  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.82 
 
 		 771 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0431388 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  36.51 
 
 		 362 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0094  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  37.07 
 
 		 721 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000375041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 362 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6470  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.07 
 
 		 584 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.527259 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  34.43 
 
 		 530 aa  159  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.71 
 
 		 891 aa  159  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1982  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.59 
 
 		 676 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0102834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1271  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.8 
 
 		 649 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 1494 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 1466 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.64 
 
 		 721 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.881722  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 1487 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>