More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2308 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.66 
 
 		 388 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  88.4 
 
 		 388 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  81.44 
 
 		 388 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  88.66 
 
 		 388 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  99.23 
 
 		 388 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  82.47 
 
 		 388 aa  675    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  98.97 
 
 		 388 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  99.23 
 
 		 388 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.66 
 
 		 388 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  81.19 
 
 		 388 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.4 
 
 		 388 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.92 
 
 		 388 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  99.23 
 
 		 388 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  88.92 
 
 		 388 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  75 
 
 		 388 aa  618  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.74 
 
 		 388 aa  617  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  75.26 
 
 		 388 aa  616  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  74.48 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 389 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.16 
 
 		 389 aa  607  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  75.52 
 
 		 388 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.45 
 
 		 388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  72.94 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  70.36 
 
 		 389 aa  598  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  71.58 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  71.65 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  72.68 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.06 
 
 		 391 aa  588  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.16 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.39 
 
 		 388 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  72.16 
 
 		 388 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  71.13 
 
 		 388 aa  579  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.26 
 
 		 390 aa  578  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  69.07 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.59 
 
 		 389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.59 
 
 		 387 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  69.59 
 
 		 387 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.3 
 
 		 409 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.78 
 
 		 387 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.3 
 
 		 409 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  68.04 
 
 		 409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.59 
 
 		 387 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.56 
 
 		 387 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  67.01 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.55 
 
 		 391 aa  542  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.8 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.92 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  62.6 
 
 		 389 aa  521  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  60.29 
 
 		 491 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  57.43 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.47 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.91 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  51.9 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.56 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  47.56 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  47.56 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.99 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  31.09 
 
 		 447 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.19 
 
 		 451 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.05 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  31.15 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  30.34 
 
 		 457 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.27 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.98 
 
 		 467 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  30.98 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.92 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 		 470 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 		 470 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  29.73 
 
 		 470 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.73 
 
 		 470 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.73 
 
 		 470 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.67 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.73 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.51 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  31.35 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  31.11 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  31.07 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.52 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  30.05 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.19 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  32.68 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  30.23 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.18 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.19 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  29.19 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  29.86 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.5 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.19 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.51 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  32.5 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.75 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.86 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  32.5 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.9 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.9 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.38 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>