More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2292 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  86.01 
 
 		 393 aa  729    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  60.71 
 
 		 392 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  51.15 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  40.21 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  38.66 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  32.58 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  30.39 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  30.15 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  32.23 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  30.79 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  30.18 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  30.69 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  29.61 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  29.9 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  29.85 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  30.18 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  29.12 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  30.27 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  27.13 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.61 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.75 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  26.77 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  26.63 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  28.33 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  26.9 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  26.84 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  26.52 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.42 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.21 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.02 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.79 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.18 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  26.13 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.69 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  26.78 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  29.22 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.58 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.6 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  27.65 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.97 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  25.26 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.64 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  26.68 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.85 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  26.94 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 422 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  23.44 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  26.96 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  23.84 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.41 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  27.23 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  24.81 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  26.55 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  26.67 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.39 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.48 
 
 		 396 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.06 
 
 		 422 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.77 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.15 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.39 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  25.93 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.3 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  24.5 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  23.79 
 
 		 461 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  23.37 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.39 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  24.24 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1719  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.18 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  26.1 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  26.12 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  25.93 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  26.55 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 449 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  25 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  27.03 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  25.51 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  26.12 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.97 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  26.73 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  27.49 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.51 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  25.89 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.51 
 
 		 394 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.94 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>