122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2167 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01894  AMP nucleosidase  90.5 
 
 
484 aa  913  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1143  AMP nucleosidase  90.5 
 
 
484 aa  913  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  9.08375e-05  hitchhiker  1.31711e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2344  AMP nucleosidase  99.79 
 
 
484 aa  998  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0273914  hitchhiker  0.00120533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2264  AMP nucleosidase  90.5 
 
 
484 aa  913  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.40487e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2572  AMP nucleosidase  89.88 
 
 
484 aa  915  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0986  AMP nucleosidase  95.29 
 
 
382 aa  758  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.63719e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2231  AMP nucleosidase  100 
 
 
484 aa  1001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.822424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2167  AMP nucleosidase  100 
 
 
484 aa  1001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.13485e-05  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2112  AMP nucleosidase  99.59 
 
 
484 aa  999  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.96443e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2824  AMP nucleosidase  90.5 
 
 
484 aa  913  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  0.783783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1846  AMP nucleosidase  74.18 
 
 
496 aa  739  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2105  AMP nucleosidase  90.29 
 
 
484 aa  911  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.25567e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1661  AMP nucleosidase  90.5 
 
 
484 aa  913  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00901346  normal  0.0509963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1671  AMP nucleosidase  90.5 
 
 
484 aa  913  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1823  AMP nucleosidase  79.92 
 
 
486 aa  800  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4704  AMP nucleosidase  66.53 
 
 
484 aa  651  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.591798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1423  AMP nucleosidase  79.96 
 
 
484 aa  809  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1955  AMP nucleosidase  74.18 
 
 
496 aa  739  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2827  AMP nucleosidase  78.54 
 
 
485 aa  782  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1215  AMP nucleosidase  78.33 
 
 
485 aa  784  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3127  AMP nucleosidase  81.78 
 
 
486 aa  833  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2179  AMP nucleosidase  100 
 
 
484 aa  1001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00600152  normal  0.598678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2669  AMP nucleosidase  64.29 
 
 
482 aa  603  1e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1413  AMP nucleosidase  62.97 
 
 
494 aa  594  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.43722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0167  AMP nucleosidase  62.68 
 
 
493 aa  564  1e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4655  AMP nucleosidase  56.55 
 
 
516 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.370825  normal  0.206703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0408  AMP nucleosidase  56.46 
 
 
492 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4833  AMP nucleosidase  56.13 
 
 
487 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4233  AMP nucleosidase  57.53 
 
 
493 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00168339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4779  AMP nucleosidase  56.34 
 
 
487 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.549989  decreased coverage  0.00166711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0641  AMP nucleosidase  56.13 
 
 
487 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133102  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4743  AMP nucleosidase  57.8 
 
 
493 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4942  AMP nucleosidase  55.51 
 
 
499 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3750  AMP nucleosidase  55.6 
 
 
490 aa  516  1e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.963566  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12490  AMP nucleosidase  54.26 
 
 
499 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1138  AMP nucleosidase  54.05 
 
 
491 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4337  AMP nucleosidase  54.15 
 
 
487 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.298005  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4795  AMP nucleosidase  53.43 
 
 
487 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0454  AMP nucleosidase  56.22 
 
 
497 aa  507  1e-142  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09370  AMP nucleosidase  55.19 
 
 
490 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0681  AMP nucleosidase  55.79 
 
 
495 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114731  normal  0.0716932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0708  AMP nucleosidase  56.2 
 
 
495 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  0.140174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0721  AMP nucleosidase  56.2 
 
 
495 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276805  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5425  AMP nucleosidase  51.57 
 
 
496 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528321  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5885  AMP nucleosidase  51.36 
 
 
496 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0214  AMP nucleosidase  51.26 
 
 
493 aa  454  1e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.939033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3922  AMP nucleosidase  51.88 
 
 
493 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4036  AMP nucleosidase  51.88 
 
 
493 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.282397  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3709  AMP nucleosidase  51.22 
 
 
493 aa  439  1e-122  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.456072  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1488  AMP nucleosidase  51.05 
 
 
485 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0485  AMP nucleosidase  51.02 
 
 
493 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4246  AMP nucleosidase  51.12 
 
 
493 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565959  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3569  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
512 aa  435  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0254113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1201  AMP nucleosidase  49.07 
 
 
498 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4876  AMP nucleosidase  48.57 
 
 
526 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501622 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0309  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
508 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2553  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
508 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.325528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0857  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
508 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0315968  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1489  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
508 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2416  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
508 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0341  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
508 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824127  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0602  AMP nucleosidase  49.18 
 
 
508 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1685  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
508 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1155  AMP nucleosidase  49.28 
 
 
493 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0642  AMP nucleosidase  50.51 
 
 
498 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2794  AMP nucleosidase  49.48 
 
 
483 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0658  AMP nucleosidase  50.1 
 
 
500 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3545  AMP nucleosidase  48.67 
 
 
506 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502164  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0088  AMP nucleosidase  49.69 
 
 
499 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3237  AMP nucleosidase  48.16 
 
 
508 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0388268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3658  AMP nucleosidase  47.96 
 
 
508 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2227  AMP nucleosidase  47.96 
 
 
508 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4496  AMP nucleosidase  47.96 
 
 
508 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168653  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3869  AMP nucleosidase  47.96 
 
 
508 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650151  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3766  AMP nucleosidase  47.95 
 
 
508 aa  418  1e-115  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00262282  decreased coverage  0.000373765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0054  AMP nucleosidase  48.36 
 
 
492 aa  417  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228346  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1387  AMP nucleosidase  48.36 
 
 
492 aa  417  1e-115  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0347338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2800  AMP nucleosidase  49.27 
 
 
488 aa  418  1e-115  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.955099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0404  AMP nucleosidase  49.17 
 
 
494 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1414  AMP nucleosidase  48.97 
 
 
504 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3289  AMP nucleosidase  47.81 
 
 
489 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6793  AMP nucleosidase  47.37 
 
 
508 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00470693  hitchhiker  1.07596e-06 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0916  AMP nucleosidase  47.22 
 
 
499 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2838  AMP nucleosidase  47.34 
 
 
510 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4414  AMP nucleosidase  47.02 
 
 
518 aa  408  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994814  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1114  AMP nucleosidase  47.73 
 
 
500 aa  407  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0963  AMP nucleosidase  47.52 
 
 
500 aa  405  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4957  AMP nucleosidase  46.8 
 
 
505 aa  406  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2704  AMP nucleosidase  47.93 
 
 
494 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.564034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3701  AMP nucleosidase  48.44 
 
 
495 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0337  AMP nucleosidase  52.87 
 
 
494 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3401  AMP nucleosidase  45.88 
 
 
517 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0546432 
 
 
-
 
NC_004310  BR0623  AMP nucleosidase  46.27 
 
 
500 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.625588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0622  AMP nucleosidase  46.27 
 
 
500 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2656  AMP nucleosidase  46.97 
 
 
500 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3407  AMP nucleosidase  45.31 
 
 
389 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474921  hitchhiker  0.0063394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  32.51 
 
 
277 aa  129  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  30.64 
 
 
258 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  29.79 
 
 
287 aa  118  2e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0368  AMP nucleosidase  30.66 
 
 
256 aa  118  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>