More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1560 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  92.49 
 
 
359 aa  650  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  91.91 
 
 
346 aa  644  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  92.77 
 
 
359 aa  651  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  92.77 
 
 
359 aa  651  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  92.77 
 
 
346 aa  650  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  100 
 
 
346 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  100 
 
 
346 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  87.57 
 
 
346 aa  641  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  100 
 
 
346 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.51187e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  99.42 
 
 
346 aa  708  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  99.71 
 
 
346 aa  709  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  92.77 
 
 
346 aa  650  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  92.77 
 
 
346 aa  650  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  92.49 
 
 
346 aa  648  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  74.28 
 
 
346 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17263e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  72.17 
 
 
349 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  72.17 
 
 
349 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  72.17 
 
 
349 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  70.43 
 
 
348 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  70.14 
 
 
348 aa  506  1e-142  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  69.36 
 
 
349 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  68.59 
 
 
349 aa  493  1e-138  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  57.77 
 
 
350 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  57.35 
 
 
357 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  54.05 
 
 
348 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  50.89 
 
 
350 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50 
 
 
346 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  53.37 
 
 
345 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 
346 aa  338  8e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  52.52 
 
 
358 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  52.52 
 
 
358 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  51.28 
 
 
361 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  51.15 
 
 
374 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  47.21 
 
 
346 aa  322  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  52.32 
 
 
383 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  49.26 
 
 
347 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.83 
 
 
343 aa  312  5e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.83 
 
 
343 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.12709e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.64 
 
 
343 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.94 
 
 
343 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.97 
 
 
343 aa  308  6e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.97 
 
 
343 aa  308  6e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.06 
 
 
343 aa  307  1e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  3.69623e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.67 
 
 
343 aa  306  5e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  43.19 
 
 
349 aa  306  5e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.67 
 
 
343 aa  306  5e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  44.97 
 
 
343 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  45.56 
 
 
346 aa  303  3e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  49.55 
 
 
360 aa  302  5e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  43.57 
 
 
342 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  50.3 
 
 
376 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  42.73 
 
 
346 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  45.86 
 
 
349 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  48.48 
 
 
349 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  46.88 
 
 
336 aa  288  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  44.67 
 
 
349 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.31 
 
 
350 aa  283  4e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.2 
 
 
350 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  43.2 
 
 
350 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  43.15 
 
 
350 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.2 
 
 
350 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.2 
 
 
350 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.2 
 
 
367 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.2 
 
 
367 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  43.15 
 
 
350 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  44.35 
 
 
350 aa  273  4e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  43.49 
 
 
350 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  42.26 
 
 
350 aa  269  6e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  42.26 
 
 
350 aa  269  6e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  43.32 
 
 
355 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  42.51 
 
 
341 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  40.3 
 
 
346 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0147  oxidoreductase domain-containing protein  42.81 
 
 
341 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  35.92 
 
 
344 aa  253  2e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  39.22 
 
 
336 aa  252  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  43.55 
 
 
363 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  39.49 
 
 
347 aa  243  4e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  41.88 
 
 
350 aa  240  3e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
337 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  39.09 
 
 
333 aa  234  2e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  40.87 
 
 
357 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  35.78 
 
 
348 aa  221  1e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  37.71 
 
 
362 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  37.04 
 
 
360 aa  218  9e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  40.53 
 
 
332 aa  213  4e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 
346 aa  212  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  38.53 
 
 
353 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  36.6 
 
 
345 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  36.89 
 
 
345 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  36.6 
 
 
345 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  36.89 
 
 
345 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.89 
 
 
345 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  36.89 
 
 
345 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  36.89 
 
 
345 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  36.89 
 
 
345 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  40.17 
 
 
345 aa  201  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
346 aa  201  2e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.51204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 
347 aa  197  2e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  35.16 
 
 
345 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  36.02 
 
 
345 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>