45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1473 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1473  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  9.26239e-08  normal  0.022042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1795  hypothetical protein  96.2 
 
 
79 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.58833e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1489  hypothetical protein  96.2 
 
 
79 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  4.83373e-05  hitchhiker  8.89895e-13 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1966  hypothetical protein  93.75 
 
 
80 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.59478e-06  hitchhiker  1.39787e-09 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1508  hypothetical protein  91.14 
 
 
79 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0719392  hitchhiker  1.92461e-09 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1510  major outer membrane lipoprotein  84.81 
 
 
78 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  9.17327e-06  hitchhiker  2.17872e-09 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1965  major outer membrane lipoprotein  84.81 
 
 
78 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.37115e-06  decreased coverage  1.67771e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1794  major outer membrane lipoprotein  84.81 
 
 
78 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  7.10111e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1490  major outer membrane lipoprotein  84.81 
 
 
78 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.17688e-06  hitchhiker  1.24306e-14 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1474  major outer membrane lipoprotein  84.81 
 
 
78 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  8.04906e-08  normal  0.0109348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2745  LPP repeat-containing protein  89.19 
 
 
78 aa  127  4e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  7.53676e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2442  LPP repeat-containing protein  89.19 
 
 
78 aa  127  4e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000387277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1767  LPP repeat-containing protein  82.28 
 
 
78 aa  126  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  8.00001e-09  unclonable  1.27827e-06 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1954  LPP repeat-containing protein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.68464e-09  unclonable  8.44814e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1519  major outer membrane lipoprotein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.33689e-10  decreased coverage  9.78616e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1893  major outer membrane lipoprotein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.01718e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01646  murein lipoprotein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.90635e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1758  major outer membrane lipoprotein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.20557e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2391  major outer membrane lipoprotein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  9.96739e-10  decreased coverage  2.5912e-06 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1965  LPP repeat-containing protein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.12979e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01636  hypothetical protein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1878  major outer membrane lipoprotein  81.82 
 
 
78 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.16329e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2186  LPP repeat-containing protein  82.28 
 
 
78 aa  123  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.06733e-11  hitchhiker  3.05308e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1748  major outer membrane lipoprotein  84.93 
 
 
78 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.4636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2583  major outer membrane lipoprotein  84.93 
 
 
81 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.15895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1854  LPP repeat-containing protein  84.93 
 
 
78 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  7.96453e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1701  LPP repeat-containing protein  74.32 
 
 
78 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.09145e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1663  LPP repeat-containing protein  74.32 
 
 
78 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  2.05201e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3344  putative outer membrane lipoprotein  47.14 
 
 
77 aa  75.5  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02887  predicted outer membrane lipoprotein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02837  hypothetical protein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0685  putative lipoprotein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3443  putative outer membrane lipoprotein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3193  putative outer membrane lipoprotein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0682  putative outer membrane lipoprotein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3299  putative outer membrane lipoprotein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.117538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3483  putative outer membrane lipoprotein  50.77 
 
 
85 aa  70.5  7e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4326  putative outer membrane lipoprotein  49.23 
 
 
85 aa  69.3  2e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0089  major outer membrane lipoprotein  45.59 
 
 
114 aa  60.1  1e-08  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.186795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2623  major outer membrane lipoprotein, putative  36.84 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0202513  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1231  major outer membrane lipoprotein, putative  34.44 
 
 
88 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.942856  normal  0.491239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1198  major outer membrane lipoprotein, putative  34.44 
 
 
88 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3159  major outer membrane lipoprotein, putative  34.44 
 
 
88 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.764364  normal  0.139344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1154  major outer membrane lipoprotein, putative  34.44 
 
 
88 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0547044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2985  major outer membrane lipoprotein, putative  33.33 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>