45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1121 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1168  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  379  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  4.48874e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1121  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  379  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.0025e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1017  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  379  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1100  hypothetical protein  99.44 
 
 
180 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  2.78688e-05  normal  0.979785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1134  hypothetical protein  99.44 
 
 
180 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  9.82581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1111  hypothetical protein  90 
 
 
180 aa  339  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  7.98367e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2370  hypothetical protein  90 
 
 
192 aa  338  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  4.38094e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2172  hypothetical protein  90 
 
 
180 aa  338  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.20846e-10  normal  0.548871 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1062  hypothetical protein  90 
 
 
192 aa  338  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.04596e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00950  hypothetical protein  90 
 
 
180 aa  338  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.81867e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00957  hypothetical protein  90 
 
 
180 aa  338  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.3428e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2697  protein of unknown function DUF1379  90 
 
 
180 aa  338  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.57658e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1055  hypothetical protein  89.44 
 
 
192 aa  337  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.52866e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2650  hypothetical protein  89.44 
 
 
180 aa  337  6e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.22204e-08  hitchhiker  0.00136169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1458  hypothetical protein  87.22 
 
 
180 aa  335  2e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00224961  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2554  hypothetical protein  67.66 
 
 
183 aa  240  8e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2643  hypothetical protein  67.66 
 
 
183 aa  240  8e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1985  hypothetical protein  67.07 
 
 
183 aa  238  3e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1741  hypothetical protein  65.87 
 
 
182 aa  234  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0888818  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1678  protein of unknown function DUF1379  60.71 
 
 
184 aa  220  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2062  protein of unknown function DUF1379  60.23 
 
 
195 aa  218  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1789  hypothetical protein  60.48 
 
 
195 aa  216  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1647  protein of unknown function DUF1379  57.4 
 
 
186 aa  201  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003437  hypothetical protein  38.24 
 
 
180 aa  126  2e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02338  hypothetical protein  37.58 
 
 
180 aa  120  1e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1097  hypothetical protein  34.94 
 
 
180 aa  110  1e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1550  hypothetical protein  36.57 
 
 
196 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1811  hypothetical protein  34.32 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.37995e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1731  hypothetical protein  32.54 
 
 
177 aa  84.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2431  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  82  4e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2438  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  82  4e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2551  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  81.6  5e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0408424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1913  protein of unknown function DUF1379  30.18 
 
 
177 aa  81.6  5e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0618258  normal  0.219466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1757  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  81.3  7e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0511465  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2591  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  80.5  1e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2474  hypothetical protein  30.77 
 
 
177 aa  80.1  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.411375  hitchhiker  0.00395627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1682  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  80.5  1e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0455206  normal  0.0971581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1787  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  79.7  2e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0844368  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1944  hypothetical protein  30.18 
 
 
179 aa  78.6  4e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2193  hypothetical protein  29.59 
 
 
177 aa  78.6  4e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2142  hypothetical protein  29.59 
 
 
181 aa  77.4  1e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.883221  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1594  hypothetical protein  30.64 
 
 
177 aa  76.6  2e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.37237e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2219  hypothetical protein  29.59 
 
 
177 aa  72.4  3e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2298  hypothetical protein  27.68 
 
 
188 aa  59.3  3e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75363  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2004  hypothetical protein  29.59 
 
 
178 aa  59.3  3e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0401483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>